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单细胞谱系追踪可记录细胞分裂历史,为解析发育生物学规律和疾病发生机制提供了关键性研究工具。当前主流方法依赖基因编辑,通过对外源人工条形码的定向编辑来标记细胞谱系,但该方法不适用于临床样品。线粒体DNA因其高突变率和易检测性,在人体谱系追踪中展现出巨大潜力。然而,受其多拷贝性和高度动态性影响,线粒体谱系追踪的准确性和适用性尚存不确定性,需系统评估与方法优化以提升其实用性。
近日,海南大学计算机科学与技术学院2022级本科生吕经纬同学在生物计算团队崔菲菲老师的指导下,在中科院二区期刊Journal of Molecular Biology(影响因子4.7)发表论文,题目为“iBitter-GRE:A Novel Stacked Bitter Peptide Predictor with ESM-2 and Multi-View Features”。该论文的第一作者为计...
LR(Nucleotide-binding leucine-rich repeat receptor)基因是植物免疫系统的核心组成部分,编码能够识别并抵御病原体入侵的受体蛋白。这些基因在植物与病原体的长期演化过程中不断发生复制和丢失,导致其演化轨迹难以捉摸。例如,单子叶植物中TNL基因的消失一直是NLR研究中的未解之谜。近日,我院马锋旺/赵涛课题组在Molecular Biology and Ev...
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)王桂荣团队在《BMC生物学(BMC Biology)》在线发表题为“Attraction and aversion of noctuid moths to fermented food sources coordinated by olfactory receptors from distinct gene f...
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)武志强课题组在国际权威期刊《BMC Biology》发表了题为“Evolutionary dynamics of mitochondrial genomes and intracellular transfers among diploid and allopolyploid cotton species”的研...
靶向蛋白降解未配对的括号或引号!Targeted Protein Degradation,TPD)作为一种新的药物研发策略,巧妙地利用了细胞自身的降解机制,实现对特定蛋白质的选择性清除。这一技术在解决传统药物难以触及的“不可成药靶点”问题上,展现了巨大潜力和前景。
2024年10月22日,方显杨研究员在《Current Opinion in Structural Biology》期刊在线发表了题为"Empowering the molecular ruler techniques with unnatural base pair system to explore conformational dynamics of flaviviral RNAs"的综述论...
金秋10月收获季节,马占山学科组连续在线发表五篇医学生态学领域重要论文,其中包括:BMC 旗下综合期刊BMC Biology背靠背发表两篇论文:第一篇作为研究方法(Methodology Paper) 发表了一项鉴定菌群样本中特有物种、富集物种的算法。该算法实际发明于大约10年前,因为申请国家发明专利而拖延到现在正式发表。另一篇则是应用该方法鉴定出了男女在15个相对应身体部...
2024年8月21日,中国科学院深圳先进技术研究院戴卓君课题组在Nature子刊Nature Chemical Biology发表题为“Degradable living plastics programmed by engineered spores”的研究工作。该工作通过对微生物进行基因编辑并产生具备极端环境耐受能力的孢子,使其可以在特定条件下分泌塑料降解酶;并通过塑料加工方法(高温、高压或有...
光不仅是光合作用的能量来源,也是影响植物次生代谢的重要环境因子。青蒿素(Artemisinin)作为治疗疟疾的核心次生代谢物,合成于中国传统药用植物青蒿(Artemisia annua L.)的分泌型盾状腺毛中,其生物合成也受到光照的调控。作为光信号转导的上游核心转录因子,ELONGATED HYPOCOTYL 5 (HY5) 能直接与植物中多个下游靶基因的启动子结合,从而参与许多光介导的反应,其...
近日,计算机科学与技术学院陕西省智能人机交互与可穿戴技术重点实验室、智能媒体与数据工程研究所马小科教授团队在基因组学顶级期刊《Genome Biology》(五年IF=17.4)发表研究成果“MNMST:topology of cell networks leverages identification of spatial domains from spatial transcriptomics...
凋落物分解是土壤养分转移的关键过程,对生态系统碳循环有重要影响。近几十年来由于全球变化加剧,凋落物分解速率(k)可能会发生显著变化,从而对陆地生态系统的功能产生深远的影响。虽然当前关于全球变化对凋落物分解影响的研究已经不少,但在全球尺度上凋落物分解对单一和联合变化因子的响应及其控制因素仍不清晰,相关研究亟待开展。
2024年4月30日,我院博士研究生李策和李楚翘以共同第一作者身份在著名生物学期刊Current Biology杂志以长文(article)形式发表题为“Wolbachia symbionts control sex in a parasitoid wasp using a horizontally acquired gene”的研究论文。栾军波教授为论文通讯作者。
2024年4月17日下午,中国科学院水生生物研究所召开2024年《水生生物学报》(以下简称“学报”)及Water Biology and Security(以下简称“WBS”)编委和青年编委会。中国科学院院士、WBS主编桂建芳,水生所研究员、学报主编殷战,水生所长、两刊副主编缪炜,水生所党委书记、学报副主编解绶启,以及责任编委、编委和青年编委等70余人参会。会议由缪炜主持。
干旱是造成植被死亡的主要驱动因素之一。在未来气候变化下干旱的强度、持续时间和频率会进一步增加,从而导致更高的森林死亡。目前的植被-干旱耦合研究很大程度上被忽视了植被响应干旱的最佳时间尺度(反映植被对干旱敏感性的一个关键指标),要么考虑了干旱时间尺度但忽略了干旱尺度的时间演变趋势,或考虑了植被-干旱敏感性的时间演变趋势而未能考虑干旱时间尺度的影响。在考虑到过去三十年植被对干旱的最佳响应时间后,植被对...

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