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苏铁nrDNA ITS区的序列多态性：不完全致同进化的证据
Cycas revoluta nrDNA ITS 致同进化 假基因 多态性
2009/10/20
本研究对苏铁(Cycas revoluta) nrDNA ITS进行克隆测序, 并以cDNA ITS为参照, 比较分析获得的序列的碱基变异、GC含量、5.8S二级结构的稳定性和5.8S保守基序的有无以及系统发育关系。结果发现苏铁nrDNA ITS存在较高的基因组内多样性, 同时, 这些分化的nrDNA ITS拷贝中包含有假基因的存在, 而且假基因与功能拷贝之间已经形成了较大的遗传分化, 这暗示...
应用nrDNA ITS和ETS序列探讨了樟科Lauraceae黄肉楠属Actinodaphne的系统演化关系。对得到的3个序列矩阵(ITS、ETS和ITS/ETS), 采用MP (maximum parsimony), ML (maximum likelihood)和Bayesian 3种分析方法进行了系统发育分析。结果显示, 本文选的黄肉楠属Actinodaphne物种与所选的月桂族中的外类群...
运用核糖体DNA内转录间隔区ITS序列对狭蕊龙胆属Metagentiana10种及其近缘属22种植物进行了系统发育分析。ITS分析结果表明狭蕊龙胆属是一个多系群:在系统发育树上,双蝴蝶属Tripterospermum和蔓龙胆属Crawfurdia的种类位于狭蕊龙胆属各分支中,而且双蝴蝶属和蔓龙胆属的种类也相互交叉;这一结果不支持将3个属各自独立为属。但是,在所有分析中,3个属共同形成一单系分支,是...
为从鼠尾草属植物中鉴别丹参品种, 采用基因测序方法, 用核糖体核酸内转录间隔区基因( nrDNA ITS) , 编码核蛋白体大亚基多肽L16 的基因( rpl16 ) 及叶绿体DNA 上包含trnL 以及trnL 和trnF 间隔区的区域基因( trnL- trnF) 的序列, 检测六种鼠尾草属新鲜植物。由于nrDNA ITS 和rpl16 突变率较高, 可以做为6 种鼠尾草的基源鉴定标记, 依此...