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本发明涉及一种棕色棉纤维色泽主效QTL连锁的SSR分子标记及用途，属于植物分子遗传学和彩色棉种质技术领域，本发明所提供的棕色纤维色泽主效QTL的分子标记的两个引物，标记NAU5235和标记NAU3496进行PCR扩增，检测扩增产物中有270bp片段和310bp片段。通过已知的染色体进行锚定，将主效QTL位点定位在第15号染色体上。同时，本发明的两个分子标记皆可用于检测其纤维色泽或者其后代的纤维色泽...
基于SSR标记的不同优势等级云南松遗传多样性分析
优势等级 遗传多样性 云南松
2019/5/27
基于SSR分子标记技术，按树高和胸径（地径）因子将样地内的植株分为优势木、中等木和劣势木3类，对不同生长优势等级云南松林木的遗传多样性变异特征进行了研究。结果表明：在林冠层，优势木的有效等位基因数、Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度分别为2.083、0.762、0.290和0.423，略高于中等木和劣势木；在更新层，有效等位基因数、Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度...
利用RAPD和SSR分子标记结合拟测交策略，对中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)“黄海1号”雌虾与野生雄虾作为亲本进行单对杂交产生的F1代，采用RAPD和SSR 两种分子标记技术初步构建了中国对虾雌、雄遗传连锁图谱。对460个RAPD引物和44对SSR引物进行筛选，共选出61个RAPD引物和20对SSR引物，用于对父母本和82个F1个体进行遗传分析。共得到母本分离标记14...
利用45对微卫星分子标记（SSR），以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)自然群体为实验材料，探讨野生群体遗传多样性研究中所需的最适样本量与标记量。实验设置6个样本量梯度，9个标记量梯度。对等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He）等遗传多样性指标的变化趋势进行统计分析。结果表明，样本量、微卫星标记的数量和多态性水平对群体遗传多样性均有...
Multiple banding pattern，a potential problem of cross—species microsatellite amplilification，happened when EST-SSR
primers of Porphyra yezoensis were used in microsatellite amplification for several ...
柑橘EST-SSR分子标记分析
柑橘 EST 微卫星 SSR
2008/2/8
摘要对来源于甜橙（CitrussinensisOsbeck）、枳壳(PoncirustrifoliataRaf.)和其他柑橘非冗余EST数据库的38124条单一基因（Unigene）序列进行了简单重复序列SSRs(SimpleSequenceRepeat)搜索，所分析的柑橘非冗余核酸序列总长23.29Mb，从中获得了8218条SSR，其中包括单碱基重复4913条（59.8%）,2碱基重复1419条...
摘要采用Genomic-SSR和EST-SSR标记技术，对来自我国北方冬麦区的18份普通小麦品种（系）的遗传多样性进行了探讨，并与系谱遗传距离进行了比较分析。研究发现，平均每个Genomic-SSR检测到的等位基因数为3.34个，明显高于EST-SSR的2.31个。遗传距离（GD）计算结果显示，18个小麦基因型之间的EST-SSR平均遗传距离较小，仅为0.3996，低于Genomic-SSR的GD...
玉米P25自交系抗锈病基因的遗传分析及SSR分子标记定位
玉米 南方型锈病 主基因-多基因混合模型 SSR 定位
2008/2/1
摘要 摘要：以玉米南方型锈病免疫自交系P25和感病自交系F349及F1、F2、B1和B2为材料，采用主基因-多基因混合遗传模型研究了P25的抗病遗传规律。结果表明：自交系P25的抗病基因为一主基因，表现为加性效应，没有检测出多基因，其在F2、B1和B2群体的遗传率分别为81.88%、38.14%和55.1%。利用SSR分子标记技术，以组合P25×F349的F2:3家系作为构图群体，构建了玉米SSR...
利用SSR标记分析玉米轮回选择群体的遗传多样性
玉米 轮回选择 遗传多样性 SSR
2008/2/1
摘要利用SSR标记技术分析了玉米基础群体DC0及其选择两轮后的群体HSC2和MSC2以及基础群体XFC0和其选择一轮后的群体XFC1的遗传多样性。结果表明：49对引物在5个玉米群体中共扩增出185个等位位点，每个SSR座位的等位基因数目为1～7个，平均为3.8个；基础群体多态性位点总数和多态性位点比例比其改良群体的略高； DC0、HSC2和MSC2 3个群体的基因平均杂合度相似，XFC0与XFC1...
我国西南地区玉米地方品种遗传多样性的SSR分子标记分析
遗传多样性 玉米地方品种 SSR标记
2008/1/24
摘要利用微卫星（SSR）标记技术和DNA混合取样方法，选取均匀覆盖玉米染色体组的42对SSR引物，检测了来自我国西南地区54个玉米地方品种的遗传多样性。在54个玉米地方品种中检测到256个等位基因，每个SSR标记的平均等位基因数为2-9，平均为6.1；根据遗传相似系数矩阵做出的树状图，将54个玉米地方品种大致划分成4类，来源于同一地区的多数玉米地方品种划分在同一类中。从54个玉米地方品种中选出11...
SSR分子标记检测出的花生类型内遗传变异
花生 SSR 遗传多样性 区别指数
2008/1/21
花生是我国重要的食用油和蛋白质来源作物, 鉴定其DNA分子多态性对品种改良和资源评价具有重要的意义。从已公布的花生Genomic-SSR和EST-SSR引物中筛选出34对引物, 用来分别鉴定花生4大类型各24份共96份品种资源的分子变异, 其中龙生型资源全部来自广西, 普通型资源中有11份从国外引进, 有13份来自广西和国内其他省市, 多粒型资源只有两份来自中国, 其他22份分别来自印度、美国和非...
开发SSR引物方法之研究动态Research Progress of Methods of SSR Primers Development
SSR标记 SSR引物 开发SSR引物 SSR引物的可转移性
2008/1/8
摘要
SSR标记是一种基于DNA长度多态性的分子标记技术，是进行群体遗传结构分析、构建遗传连锁图谱非常有效的工具。由于SSR标记是特异引物标记，必须在知道某个物种DNA序列的前提下，才能设计引物进行PCR扩增，故而存在一个引物开发的问题。从SSR标记的发展历程来看，开发SSR引物的方法有经典的构建与筛选基因组文库的方法、微卫星富集法、省略筛库法和数据库搜索法等四种。本文综述了这四种方法的操作流...
栓皮栎天然群体SSR遗传多样性研究Genetic Diversity of Microsatellites（SSRs）of Natural Populations of Quercus variabilis
栓皮栎 微卫星(SSR) 遗传多样性 遗传分化
2008/1/8
摘要
利用微卫星(SSR)标记对我国4个省内的5个栓皮栎（Quercus variabilis Bl.）天然群体的遗传多样性进行了研究。16对SSR标记揭示了栓皮栎丰富的遗传多样性：等位基因数（A）平均8.4375个，有效等位基因数(Ne)平均为5.9512个，平均期望杂合度(He)0.8059，Nei多样性指数(h)为0.8041。栓皮栎自然分布区中心地带的群体具有较高的遗传多样性，而人为对森...
我国陆地棉基础种质遗传多样性的SSR分子标记分析
基础种质 SSR 遗传多样性
2007/12/7
摘要利用398对BNL、JESPR 、TMB等SSR引物，对不同亲本来源、不同选育时期、不同种植生态区的43份陆地棉基础种质进行了遗传多样性的SSR分子标记分析。扩增产物用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶检测,银染观察并照相。遗传多样性带型分析按位点多态信息量（PIC），Shannon-weaver多样性指数（H’）等方法，利用NTSYSpc2.1软件计算品种间的遗传相似系数（Jaccard系数），并用...