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雷蒙德氏棉3条染色体特异BAC的筛选与定位
雷蒙德氏棉 单染色体 细菌人工染色体 荧光原位杂交
2014/4/1
通过筛选海岛棉BAC文库并结合BAC-FISH技术成功获得雷蒙德氏棉D501、D502和D510染色体的特异BAC克隆，可作为这3条染色体的细胞学标记。这3个克隆在雷蒙德氏棉和海岛棉中进行比较作图，结果表明，它们在海岛棉中均表现出了染色体特异性，说明这3个BAC也可用于海岛棉Db01、Db02和 Db10染色体的识别。其中BAC克隆280G06在两棉种10号染色体上的位置为非线性关系，可能在棉属的...
利用磁珠富集马铃薯BAC文库中NBS-LRR类晚疫病抗性基因
马铃薯 晚疫病 抗性基因
2011/6/3
栽培马铃薯是高度杂合的四倍体作物，利用传统的基因克隆方式进行晚疫病抗性基因分离难度很大。然而，晚疫病抗性基因具有序列保守性，属于NBS-LRR类基因。本研究中，根据晚疫病抗性基因R3a家族的序列比对结果设计R3a基因家族的保守探针，并将含有R3a基因的BAC SH23G23部分酶切成7~11 kb DNA片段。通过结合保守探针的磁珠系统对上述7~11 kb DNA片段进行R3a基因分离，将磁珠富集...
水稻培矮64S(PA64S)基因组BAC文库的构建与分析
水稻 PA64S 细菌人工染色体 基因组文库
2010/8/25
9311和培矮64S(PA64S)分别是我国超级杂交稻两优培9(LYP9)的父母本,9311的基因组已由北京基因组研究所测序,而PA64S至今仍无任何可供公众使用的基因组资源,对PA64S基因组的研究将有助于对9311和PA64S这对亲本基因组的比较研究和其上优良基因的克隆,为LYP9的基因组研究提供帮助。以水稻PA64S的幼嫩叶片作为材料,为该品种构建了第一个高覆盖率、高质量的BAC文库。该文库...
摘要水稻白叶枯病抗性基因Xa4已被定位于第11染色体长臂末端的分子标记G181和L1044之间，并与抗性基因同源序列片段RS13 共分离。利用这3个标记筛选IRBB56的BAC文库，共得到128个阳性BAC克隆，其中RS13获得18个阳性克隆，这18个克隆中有4个和6个克隆分别同时为G181和L1044的阳性克隆。选其中的12个克隆进行分析，构建了一个从G181到L1044区间的BAC跨叠克隆群，...
高覆盖率水稻BAC库的构建及抗病基因相关克隆的筛选
细菌人工染色体（BAC）文库 基因组 克隆 抗病 水稻
2008/1/31
摘要利用含Xa4、xa5和xa133个水稻白叶枯病抗性基因的累加系IRBB56构建了一个水稻细菌人工染色体文库。该文库包含55296个克隆，平均插入片段为132kb。按水稻基因组为450Mb 计，该文库覆盖14倍基因组，筛选出任一水稻基因或序列的概率为99.99%。用均匀分布的3个叶绿体基因和4个线粒体基因克隆作探针筛选文库，结果显示该文库中含细胞器基因组DNA同源序列的克隆数小于1%。用分布于水...
PCR筛选BAC文库和直接BAC末端测序方法的建立
BAC文库 PCR法筛选 指纹图谱 重叠群
2008/1/20
摘要 建立了一种用PCR方法筛选富含高度重复序列的大麦BAC DNA 文库和直接对 BAC DNA进行末端测序的方法。用PCR技术进行大麦BAC DNA 文库（含816个平板，每个平板含384个克隆）的筛选分4步进行。在实验中，建立了两个水平的BAC DNA池（一级池和二级池）。一个二级池由一个平板（含有384个克隆）的DNA 组成，一个一级池由连续10个稀释100倍的二级池的DNA混合而成（如1...
稻属不同染色体组着丝粒BAC克隆的分离和鉴定
野生稻 着丝粒 细菌人工染色体 荧光原位杂交
2008/1/12
摘要着丝粒在真核生物有丝分裂和减数分裂染色体正常的分离和传递中起着重要的作用。通过构建5个稻属二倍体野生种的基因组BAC文库, 采用菌落杂交和FISH技术, 筛选和鉴定了各染色体组着丝粒克隆, 并且分析了这些克隆在不同基因组间的共杂交情况, 结果表明: (1) C染色体组的野生种O. officinalis 和F染色体组的野生种O. brachyantha具有各自着丝粒特异的卫星DNA序列, 并且...
红莲型水稻不育系和保持系线粒体基因组BAC文库的构建
细胞质雄性不育 线粒体基因组 BAC文库
2008/1/4
以红莲型(HL)细胞质雄性不育系和保持系为材料, 构建了水稻线粒体基因组的BAC文库. 每个文库保存约2300个菌落, 外源插入片段介于9～25 kb之间. 以线粒体基因为探针对文库进行菌落原位杂交验证, 均筛选到了阳性克隆. 构建的两个文库为进一步研究水稻线粒体基因组的结构特点, 为克隆与红莲型水稻细胞质雄性不育相关的线粒体基因奠定了基础.
用覆盖抗褐飞虱基因Bph15的两个BAC克隆，即20M14 (27 kb)和64O9 (36 kb)作为探针，对非洲栽培稻、药用野生稻和宽叶野生稻体细胞染色体进行荧光原位杂交(FISH)。两个BAC克隆均被定位于非洲栽培稻和药用野生稻第4染色体的短臂上，杂交信号的百分距离分别为37.03±4.11和81.22±3.62，相应的信号检出率为41.18%和38.22%。在宽叶野生稻中，有两对同源染色体...
利用水稻BAC克隆对Gm-2和Gm-6在药用野生稻中的FISH定位
药用野生稻 FISH 物理定位 BAC克隆
2010/1/26
采用栽培稻遗传图第 4连锁群中与抗稻瘿蚊基因,Gm- 6和 Gm- 2等位的 RFL P标记 RG2 14和 RZ5 6 9筛选出来的两个 BAC克隆为探针 ,对药用野生稻进行了荧光原位杂交物理定位。两个BAC克隆的大小分别为 5 0 kb和86 kb,在 Cot- 1DNA封阻的情况下它们均被定位于药用野生稻第 4染色体长臂 ,与着丝粒百分距为72 .33± 4.40、77.10± 2 .40 ...