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本发明公开了一种棉花纤维长度相关microRNA及编码该棉花纤维长度相关microRNA的前体DNA，所述棉花纤维长度相关microRNA序列为如SEQ ID NO：1所示的核酸序列或由SEQ ID NO：1所示序列经过一个或几个核酸的取代和/或缺失和/或添加且与棉花纤维长度相关的衍生的核酸序列。本发明提供的棉花纤维长度相关microRNA及其前体DNA，将前体DNA导入棉花，可以显著提高棉花纤维...
DNA甲基化调控荔枝种子发育的机制获新进展
DNA甲基化 荔枝 种子发育
2024/4/16
近日，华南农业大学园艺学院研究员李建国团队在岭南现代农业科学与技术广东省实验室和国家现代荔枝龙眼产业技术体系项目资助下，研究揭示了DNA甲基化调控荔枝种子发育的机制。相关成果发表于《实验植物学杂志》（Journal of Experimental Botany）。
New Phytologist丨中国农业大学农学院小麦研究中心揭示小麦多倍化过程中DNA甲基化重塑调控根系优势性状形成（图）
小麦 多倍化过程 DNA 甲基化重塑 根系 优势性状形成
2024/5/21
2024年2月16日，中国农业大学农学院小麦研究中心在New Phytologist在线发表了题为"Reshaped DNA methylation cooperating with homoeolog-divergent expression promotes improved root traits in synthesized tetraploid wheat"的研究论文，揭示小麦多倍化过程...
DNA 腺嘌呤第六位氮原子上的甲基化（6mA）修饰最早发现广泛存在于原核生物基因组中，保护基因组免受外源DNA入侵。近年来，多种真核生物基因组DNA上的6mA 修饰也被发现，且其在基因组中的分布、丰度和功能存在显著差异。由于不同物种的基因组、染色质结构以及染色质修饰方式的不同，6mA可作为转录激活或抑制的表观标记发挥作用，可以参与干细胞发育、非生物胁迫的响应等。6mA修饰一般由腺嘌呤甲基转移酶ME...
南京农业大学农学院《Plant Cell》发表宋庆鑫教授团队“Asymmetric variation of DNA methylation during domestication and de-domestication of rice”（图）
宋庆鑫 水稻栽培 基因
2023/10/28
水稻是全球最为重要的粮食作物之一，在其漫长的驯化过程中形成了形态各异的水稻栽培亚型，包括粳稻、籼稻、Aro和Aus等。在水稻栽培种植历史过程中，有些水稻逐渐恢复部分野生稻表型特征，最终演化成严重威胁全球水稻产量的杂草稻，这种现象称之为“去驯化”。通过基因组进化研究发现，大量驯化位点的变异在去驯化过程中并不能得到恢复，这就暗示着可能存在别的遗传机制来调控杂草稻在去驯化过程中恢复野生稻表型。DNA甲基...
创新点：（1）创建了杂交水稻品种真实性和种子纯度DNA指纹鉴定方法，实现检测结果准确性和时效性的统一。（2）开发了简便实用的检测试剂盒，实现降本增效。（3）建立了全国杂交水稻主产区主栽品种指纹数据库和数字身份证，实现品种DNA指纹实时查询和比对。形成国家、行业标准各1项，地方标准2项，发明专利7项。采用DNA指纹鉴定技术标准结合检测试剂盒、指纹数据库结合品种身份证等技术措施；运用“科研单位+检测机...
育成品种的DNA身份鉴定是植物新品种保护、审定的关键环节，也是种业知识产权保护的有力工具。目前，水稻品种的分子鉴定主要以简单序列重复（SSR）标记为主，然而SSR标记分布不均匀，且成本相对较高，实验耗时，精准性不足。虽然近年来也开发了基于单核苷酸多态性（SNP）的基因芯片和简化基因组测序（GBS）等鉴定手段，但由于检测成本过高、分析流程复杂等缺点，在一定程度上限制了其推广应用。竞争性等位基因特异性...
河南省农业科学院发现DNA甲基化参与调控小麦面筋品质（图）
DNA 甲基化 小麦 面筋品质
2022/6/21
近日， 河南省农业科学院丰产优质小麦育种创新团队与河南农业大学、郑州大学合作，解析了DNA甲基化参与调控小麦面筋强度的分子机制，为优质小麦品种选育提供了新思路、新方法。相关研究结果以“Promoter DNA hypermethylation of TaGli-γ-2.1 positively regulates gluten strength in bread wheat”为题，发表在《Jour...
种子既是植物繁殖延续的载体，也是人类粮食的主要来源。种子发育及其储藏物质累积的分子调控机理一直是植物学、农学和种子生物学研究的核心内容之一。近年来，人们已经鉴别了大量控制种子发育的关键基因和调控因子，但关于这些关键因子是如何在种子中被特异被激活的，从而参与种子发育和储藏物质累积，其分子机制尚不十分清楚。DNA甲基化作为一种重要的表观修饰，主要参与转座子沉默和基因的表达调控，在植物生长发育中发挥着重...
An integrated platform and meta-learner for feature engineering machine learning analysis and modeling of DNA, RNA and protein sequence data
python 工具包 蛋白质序列
2024/5/17
一个全面和通用的基于python的工具包，集成了特征提取、聚类、归一化、选择、降维、预测器构建、最佳描述符/模型选择、集成学习和DNA、RNA和蛋白质序列结果可视化的功能。用户只需要上传自己的数据集，并从中计算出自己需要的功能，所有必要的程序和优化设置都由软件自动完成。iLearn包括DNA、RNA和蛋白质的各种描述符，支持四种特征输出格式，以便于直接使用输出或与其他计算工具通信。总的来说，iLe...
近日，北京农林科学院玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室基因组编辑团队在The Crop Journal（IF=3.179，中科院Q1期刊）上发表题为“Highly efficient CRISPR-SaKKH tools for plant multiplexcytosine base editing”的研究论文，建立了基于金黄色葡萄球菌Cas9变体SaKKH实现多重靶点编辑的胞嘧啶碱基编辑...
南京农业大学农学院《PNAS》发表水稻抗病遗传育种课题组“The effect of RNA polymerase V on 24-nt siRNA accumulation depends on DNA methylation contexts and histone modifications in rice”（图）
水稻抗病 遗传育种 转基因育种
2022/3/23
2021年7月22日，“作物遗传与种质创新国家重点实验室”的水稻抗病遗传育种课题组在《PNAS》在线发表了题为“The effect of RNA polymerase V on 24-nt siRNA accumulation depends on DNA methylation contexts and histone modifications in rice”的研究论文（Article）。...
动植物生命广泛受到各种复杂环境的影响。相比于动物可以主动躲避环境压力，植物是固着不移动的，这些压力通过引起DNA损伤来抑制植物的生长和发育。因此，它们可能进化出了不同于动物的策略维持基因组稳定，减少伤害并有效地自我修复以保持健康。那么和人类息息相关的水稻又是如何应对这些损伤的呢？最近，广东省农业科学院农业生物基因研究中心在国际植物学TOP期刊《Plant Journal》（Q1/IF：6.41）上...
动植物生命广泛受到各种复杂环境的影响。相比于动物可以主动躲避环境压力，植物是固着不移动的，这些压力通过引起DNA损伤来抑制植物的生长和发育。因此，它们可能进化出了不同于动物的策略维持基因组稳定，减少伤害并有效地自我修复以保持健康。那么和人类息息相关的水稻又是如何应对这些损伤的呢？
近日，中国科学院东北地理与农业生态研究所夏正俊课题组在《植物学报》上发表题为“快速、无损大豆种子连续取样技术及其DNA制备”的技术论文，为种子纯度及品种鉴别及分子设计育种提供了技术支撑。本技术利用微型电钻和空气泵等简单装置巧妙地设计了一个连续无损钻取大豆种子的操作流程,当钻头钻至种子的胚乳部分时,左手将移液枪头的粗端置于钻头下,枪头管收集约5.85–9.75mg的大豆种子的胚乳组织。本技术特点为可...