搜索结果: 1-15 共查到“蔬菜学 SSR”相关记录22条 . 查询时间(0.125 秒)
韭菜全长转录组SSR信息分析及分子标记开发
韭菜 全长转录组 SSR 无融合生殖
2020/6/18
利用MISA软件筛选韭菜(Allium tuberosum)全长转录组测序获得的49 876条(大于500 bp)转录本序列(89.44 Mb),共检测出13 111个SSR位点,分布在10 332条转录本中,SSR出现频率为26.29%,平均分布距离为6.82 kb。在搜索的6种SSR位点类型中,1 ~ 3个核苷酸重复类型占主要地位,占总SSR位点数的98.74%,其中单核苷酸、二核苷酸和三核苷...
菜薹品质性状与SSR标记的关联分析
菜薹 品质性状 SSR标记 关联分析
2019/11/5
为挖掘与菜薹品质性状相关的分子标记,选用具有多态性的84个SSR标记分析了81份菜薹种质材料的遗传多样性,并采用TASSEL3.0软件中混合线性模型(MLM)对菜薹群体材料的单株质量、叶绿素含量、维生素C含量、可溶性总糖含量、可溶性蛋白含量和硝酸盐含量等6个品质性状进行关联分析。结果显示,84个SSR标记在81份菜薹种质材料中共检测出310个等位位点,引物多态信息量(PIC)在0.1878 ~ 0...
对香椿进行染色体核型分析和SSR分子标记的开发。染色体核型分析发现两个居群的香椿染色体数都是56条,为2A型,香椿的染色体较为原始,变异较小。转录组测序结果共获得66 921条Unigene,从中检索得到13 324个SSR位点,分布于11 184条Unigene中,SSR出现频率为19.91%,平均分布距离为3.84 kb。优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,分别占SSR总数的62.33...
利用SRAP和EST-SSR分析香椿资源的遗传多样性
香椿 遗传多样性 SRAP EST-SSR
2018/6/15
利用SRAP和EST-SSR标记技术对中国9省10个香椿居群的遗传多样性和亲缘关系进行了分析,试图为香椿种质资源的保护和开发利用奠定基础。结果表明,33对SRAP标记共扩增出167个多态性位点,平均每对引物产生5.06个多态性位点;45对EST-SSR引物共检测到221个多态性位点,平均每对引物检测到4.9个多态位点;所选香椿居群的等位基因数和期望杂合度(EST-SSR,Na = 2.3506,H...
利用黄秋葵转录组信息挖掘SSR标记及用于种质分析
黄秋葵 转录组 SSR 多态性
2018/3/27
通过对黄秋葵(Hibiscus esculentus L.)转录组信息分析,共获得74 600条unigene,全部序列有52 976 011 bp;有3 191条unigene包含SSR的序列,从中鉴定出3 448个SSR位点,其中有235条序列包含1个以上SSR,复合SSR有123个。优势重复基序为三核苷酸和二核苷酸,分别占总SSR的60.79%和21.43%。二核苷酸重复基元中以AG/CT为...
利用SSR 标记分析蚕豆品种(品系)与优异种质的遗传多样性
蚕豆 蚕豆育成 蚕豆材料
2018/4/9
利用99 对SSR 荧光标记对102 份国内蚕豆育成品种(品系)和优异种质资源进行遗传多样性分析。结果表明:99对SSR 标记共检测出937 个等位变异,每对标记平均检测出4~19 个等位变异,平均为9.46 个;多态性信息量(PIC)变化范围为0.38~0.88,平均为0.63;有效等位变异(Ne)变化范围为1.79~9.22,平均为3.41;Shannon 信息指数变化范围为0.79~2.44...
番茄品种SSR 标记鉴定技术研究
番茄 SSR 品种鉴定 指纹图谱
2018/4/28
以16 个番茄品种为材料,从200 对番茄SSR 引物中筛选出20 对适合用于番茄品种鉴定的引物,用该20 对引物对66 个番茄品种进行分析,共检测出52 个等位基因变异,等位基因变异范围为2~5 个,平均每个位点产生2.6 个等位基因变异。通过遗传聚类方法对引物组合的品种鉴别能力进行分析,结果显示仅用9 对引物构成的引物组合就可以对66 个番茄品:番茄;SSR;品种鉴定;指纹图谱种进行有效鉴别,...
为筛选芥蓝× 甘蓝型油菜种间杂交后代的遗传背景,加速回交转育进程,采用蕾期授粉结合胚挽救手段进行远缘杂交,获得芥蓝和甘蓝型油菜的种间杂种F1 和BC1 群体。利用已有的220 对SSR 引物对双亲进行多态性筛选,获得多态性引物51 对。挑选均匀分布在甘蓝9 条染色体上、扩增稳定、条带清晰的33 对多态性SSR 引物,对3 株F1 单株和35 株BC1 单株进行遗传背景筛选。NTSYSpc2.11a...
番茄品种SSR标记鉴定技术研究
番茄 SSR 品种鉴定 指纹图谱
2018/5/8
以16 个番茄品种为材料,从200 对番茄SSR 引物中筛选出20 对适合用于番茄品种鉴定的引物,用该20 对引物对66 个番茄品种进行分析,共检测出52 个等位基因变异,等位基因变异范围为2~5 个,平均每个位点产生2.6 个等位基因变异。通过遗传聚类方法对引物组合的品种鉴别能力进行分析,结果显示仅用9 对引物构成的引物组合就可以对66 个番茄品:番茄;SSR;品种鉴定;指纹图谱种进行有效鉴别,...
为筛选芥蓝× 甘蓝型油菜种间杂交后代的遗传背景,加速回交转育进程,采用蕾期授粉结合胚挽救手段进行远缘杂交,获得芥蓝和甘蓝型油菜的种间杂种F1 和BC1 群体。利用已有的220 对SSR 引物对双亲进行多态性筛选,获得多态性引物51 对。挑选均匀分布在甘蓝9 条染色体上、扩增稳定、条带清晰的33 对多态性SSR 引物,对3 株F1 单株和35 株BC1 单株进行遗传背景筛选。NTSYSpc2.11a...
甜瓜种质资源遗传多样性的SSR分析
甜瓜 遗传多样性 SSR
2018/6/28
利用SSR分子标记技术对72份甜瓜种质资源及育种材料进行DNA指纹分类及亲缘关系研究,20对SSR引物共扩增产生76个多态性位点,平均每对引物产生3.8个多态性位点。聚类结果将72份甜瓜种质资源分为7个类群,其中类群I包括新疆本地资源及几乎全部自育甜瓜种质资源64份材料,这说明本试验所选用的新疆厚皮甜瓜种质资源遗传背景比较狭窄。
以10 份大白菜杂交种及其亲本为研究对象,基于NCBI 基因组数据库中EST 序列信息,应用SSR 标记及高分辨 率溶解曲线技术筛选出用于大白菜杂交种纯度鉴 定的SNP 位点及复合 SSR 位 点,并根据 高通量分子检测技术 种子纯度鉴定的需要 ,对单粒种子育苗条件、单株植株提取 状态、快速DNA提取方法、复合PCR 体系的建立等关键 技术进行了摸索及优化。结果显示:经过48 h 破壳状态的单粒种...
番茄种质资源亲缘关系的SSR分析
番茄 种质资源 亲缘关系 SSR
2018/9/29
采用25对SSR特异引物对20份番茄材料进行分析,其中21对引物扩增出条带,18对引物具有多态性,扩增出的66条谱带中有52条具有多态性,多态率为78.8%。遗传距离分析结果表明:20份番茄材料两两间的遗传距离(GD)在1.489 2~9.180 6之间,遗传距离大于7的育种材料共有18份,其中No.1与No.15之间的遗传距离最大,为9.180 6。以遗传相似系数0.67为标准可将20份番茄育种...
基于SSR分子标记的栽培种茄子遗传多样性分析
茄子 SSR标记 多态性
2018/9/29
用105对茄子SSR引物对34份茄子高代材料进行遗传多样性分析。试验结果表明:47个标记在供试材料中有多态性,共检测出148个多态性位点。多态性信息含量(PIC)的变化范围是0.025 4~0.909 3,显示了较高的多态性。供试材料遗传相似系数在0.63~0.93之间,供试材料之间的遗传差异不大,遗传基础相对狭窄。利用UPGMA聚类分析,将供试材料归为两大类4个亚类,SSR分子标记与果实性状聚类...