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藻类rDNA特异性片段长度多态性在溺死鉴定中的应用
法医病理学 法医遗传学 硅藻类 DNA 核糖体 第二内转录间隔区 扩增片段长度多态性分析 溺死
2019/4/25
通过检验水体和人体器官中硅藻核糖体DNA（rDNA） 5.8S部分序列、第二内转录间隔区（second internal transcribed spacer，ITS2）序列（5.8S+ITS2）的长度多态性差异，判断溺水死亡案件中受害人的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被抛尸入水。 方法 以南京市公安局法医中心受理的2例硅藻检验鉴定案例为对象，利用5.8S+ITS2分子标记的长度多态性，分析...
16S rDNA测序在呼吸机相关性肺炎痰液细菌多样性分析中的应用
呼吸机相关性肺炎 痰液 细菌培养
2014/10/17
用 16S?rDNA 测序研究呼吸机相关性肺炎 （ VAP）患者痰液中致病菌的种类和丰度，探讨VAP 病原学诊断的新方法。 方法 对 31 例 VAP 患者进行支气管肺泡灌洗，提取痰液标本细菌 DNA，进行聚合酶链反应 （ PCR）鉴定，同时进行痰液细菌培养。利用 16S?rDNA 测序技术进行宏基因测序及生物信息学分析，并将测序结果与细菌培养结果比较。
2株间日疟原虫18S rDNA的克隆及其同源性分析
间日疟原虫 18S rDNA 序列同源性分析
2014/6/11
克隆间日疟原虫河南分离株与湖北分离株红内期18S rDNA，并进行同源性分析。 方法 采用PCR方法从间日疟患者血样DNA中扩增间日疟原虫18S rDNA，纯化后与pGEM-Teasy质粒连接，转化大肠埃希氏菌JM109；阳性克隆质粒经双酶切鉴定后，进行序列测定，采用BLAST和MEGA4生物软件分析同源性。 结果 间日疟原虫18S rDNA扩增片段大小为998 bp；阳性克隆重组质粒经双酶切鉴定...
阐明中国按蚊属按蚊亚属蚊种的亲缘关系。方法 根据核糖体DNA第2内转录间隔区(rDNA-ITS2)序列,采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最小进化法(ME)和最大似然法(ML),对采自中国的按蚊亚属22种(分子型)蚊虫进行系统发育关系重建。结果 rDNA-ITS2序列的长度范围为340～1754 bp,种内的p遗传距离均小于0.004,种间为0.009～0.420,平均值为0.224。各种方...
建立创伤弧菌基因分型的新方法,了解创伤弧菌的分子特征。方法 应用PCR-变形梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对创伤弧菌的16S-23S rDNA间区(16S-23S rDNA intergenic spacer regions,ISR)多态性进行分析比较,结合药敏试验,以进一步验证分离菌株之间的亲缘关系。结果 ISR-PCR将创伤弧菌菌株扩增出4条约900、750、650、550bp大小不同的...
用地衣红-卡红染色进行共生菌的形态观察，鉴定棘阿米巴CB/S1内共生细菌。克隆内共生细菌的16S rDNA基因，进行基因序列分析。结果表明，经地衣红-卡红染色棘阿米巴CB/S1内共生细菌呈黑色和棒状，在胞质内不规则分布。棘阿米巴CB/S1内共生细菌的16S rDNA基因长1 534 bp，与类亚洲嗜阿米巴杆菌（Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2）和韩国棘阿米...
不同来源白首乌rDNA ITS序列分析
白首乌 克隆 ITS序列 序列分析
2012/8/16
研究白首乌不同种的ITS序列遗传差异性,分析序列差异性在白首乌品种鉴定及种质资源研究中的意义。 方法: 从不同来源的白首乌中提取总DNA, 以核基因组ITS通用引物进行扩增,扩增产物经克隆后,进行测序。 结果: 获得4个不同来源样品的ITS全序列及5.8S全序列以及两端的18S,26S的部分序列,其中戟叶牛皮消Cynanchum bungei ITS序列为国际首次获得,登录号分别分别为GU1989...
中国不同地区蛇床的rDNA ITS序列分析
蛇床 rDNA内转录间隔区 纬度
2010/1/12
目的：探讨不同分布区的蛇床Cnidium monnieri的ITS序列变异与其地理分布和化学成分的相关性。方法：设计2对引物，Pf+Pb及P5.8S ITS1+P5.8S ITS2，PCR扩增产物纯化后用银染法或ABI 310测序。结果：得到核糖体DNA中的ITS及5.8S rDNA完全序列，18S和26S rDNA部分序列,共约700 bp。5个地点样品的ITS-1及ITS-2的序列大小分别为2...
Single Strand Conformation Polymorphism analysis of PCR-amplified rDNA to differentiate medically important Aspergillus Species
SSCP Aspergillus Identification PCR
2009/12/9
Background: Aspergillus species are associated with allergic bronchopulmonary disease, mycotic keratitis, otomycosis, nasal sinusitis and invasive infection. In this study, we developed a PCR-Sin...
甘肃野生秦艽rDNA ITS区序列分析
甘肃 秦艽 ITS序列
2012/8/6
比较研究甘肃不同地区4种野生秦艽rDNA ITS碱基序列的差异及其规律,寻找秦艽组药材之间的分子鉴别方法。 方法: 对rDNA ITS区进行了PCR扩增、测序,运用Clustal X,MEGA3等软件对ITS区序列进行分析。 结果: 不同地区秦艽、麻花秦艽、小秦艽及黄管秦艽的ITS长度为800 bp,ITS1,5.8S和ITS2序列长度分别为290,170,340 bp。根据两者序列以邻接法建立分...
韩茵陈等3种药材基源rDNA内转录间隔区的序列分析鉴定
韩茵陈等3种药材 基源rDNA内转录间隔区 序列分析
2009/3/27
目的：建立一种简便、实用的亲缘关系相近的茵陈类药材DNA分子鉴定方法；找出中韩两国茵陈药材在遗传学上的差异。方法：采用聚合酶链反应产物直接测序法对3种茵陈（茵陈蒿、韩茵陈和白莲蒿）进行鉴别。从3种茵陈的组织材料中提取DNA，扩增rDNA的内转录间隔区（internal transcribed spacers, ITS）和5.8 s的序列。对扩增产物进行了DNA序列分析。结果：韩茵陈、白莲蒿在PCR...
探讨精氨酸增强的胃肠外营养对胰腺癌患者介入治疗术后血清可溶性肿瘤坏死因子受体1（sTNFR1）和T淋巴细胞rDNA转录活性水平的影响及其临床意义。方法分别用酶联免疫法（ELISA）和核仁形成区相关蛋白银染技术测定50例中晚期胰腺癌患者（胰腺癌组）行动脉栓塞化疗术治疗前后血清sTNFR1和外周血T淋巴细胞rDNA转录活性的改变，并与健康对照组比较分析。结果胰腺癌组介入治疗前sTNFR1增高，外...
不同地区微小按蚊rDNA-ITS2序列差异
微小按蚊 核糖体DNA 第2内转录间隔区 序列
2009/2/25
目的 比较我国云南、海南省、广西壮族自治区及泰国等不同地区微小按蚊核糖体 DNA第 2内转录间隔区 ITS2 )序列差异。 方法 取单只雌蚊蚊腿消化提取 DNA,PCR特异扩增 r DNA- ITS2片段 ,并对其扩增产物纯化、测序及分析。 结果 发现 2种不同的 ITS2序列 Gen Bank登录号 :AF4 16 783,AF4 16 784 ) ,分别与微小按蚊 A和 C同源 ,ITS2序列...
从吉林延边地区土壤中分离的棘阿米巴属CJY/S1和CJY/S2株中提取基因组18S rDNA，PCR扩增、克隆、测序后用分子生物学软件Clustal X进行序列分析，与基因库中已有T1至T12型序列进行比较并构建进化树。结果棘阿米巴土壤分离株Acanthamoeba sp. CJY/S1和CJY/S株的18S rDNA全基因序列分别为2 255 bp和2 252 bp，均属T4基因型。
广西两地旋毛虫分离株5S rDNA序列分析
旋毛虫 5S rDNA 基因 分离株
2009/2/24
目的 应用5S rDNA序列分析，鉴定广西德保、南丹两地旋毛虫分离株。 方法 PCR扩增2个分离株5S rDNA片段，并对扩增产物进行测序；用相关软件分析序列的同源性、遗传距离，同时构建系统发生树，并与GenBank中旋毛虫相应基因序列进行比较。 结果 广西德保、南丹2地旋毛虫分离株和GenBank中Trichinella spiralis的5S rDNA碱基序列长度相同，为695 bp；变异位点...