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指环病毒6实时荧光定量PCR检测体系的建立与验证
指环病毒6 实时荧光定量PCR 敏感性 特异性
2020/3/10
建立指环病毒(Torque teno virus,TTV)6实时荧光定量PCR检测体系,并验证检测体系的敏感性与特异性。根据GenBank中登录的TTV6基因序列设计引物与FAM-Eclipse探针,建立基于FAM-Eclipse探针法的实时荧光定量PCR检测方法,建立标准曲线并进行敏感性与特异性分析。
应用QIAxcel毛细管电泳系统建立一种能够同时检测7种鼠传病原体的多重PCR检测方法。方法 应用微生物数据分析云平台(https://analysis.mypathogen.org/)中"special marker gene"工作流,筛选恙虫病东方体、嗜吞噬细胞无形体、莫氏立克次体、土拉弗朗西斯菌、贝氏柯克斯体、问号钩端螺旋体和巴尔通体特异基因,据此设计引物。根据温度转换PCR原理构建特异性嵌...
建立特异敏感的荧光定量PCR (FQPCR) 方法,用于新型H7N9 流感病毒的快速检测。方 法 针对GenBank中新型H7N9流感病毒(2016年以后)的血凝素基因和神经氨酸酶基因序列的保守区域 分别设计两对特异性引物和两条探针,经优化反应条件,建立一种基于TaqMan MGB探针技术的FQPCR 方法,验证方法的敏感性、特异性和稳定性, 对2017 年采集的临床疑似感染样品进行检测, 并...
调查北京市部分城郊区6种鼠传病原体流行状况。方法 将已报道的TaqMan探针实时荧光定量PCR(qPCR)检测方法在本实验室进行评估,制备质粒标准品和绘制标准曲线,依据重新评估的数据确定结果的检测阈值。2017年1-6月应用夹夜法在北京市朝阳、怀柔、门头沟和平谷4个地区捕获啮齿动物,采集组织样品提取核酸,应用上述qPCR方法检测病原体。
利用转录介导的扩增技术(transcription mediated amplification,TMA) 扩增HCV RNA,并与实时荧光定量反转录聚合酶链反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR) 进行比较,探讨TMA 系统的稳定性及其与RT-PCR 的灵敏性差异和相关性,以及TMA 临床应用的意义。...
研究rrf(5S)~rrl(23S) rRNA基因间隔区巢式PCR用于疑似莱姆病患者血清标本的检测效果。方法 收集疑似莱姆病患者血清标本及其流行病学和临床资料,提取DNA进行巢式PCR、普通PCR检测。结果 共收集102份疑似莱姆病患者血清,巢式PCR检测阳性39例,阳性率为38.23%,其中蜱叮咬时间在2个月内的为33例,占84.62%;普通PCR只有1份阳性,阳性率为0.98%,远低于巢式PC...
建立敏感、特异、定量Real-time PCR方法,用于恙虫病东方体的检测。方法 根据恙虫病东方体56 kD外膜蛋白基因序列设计引物和探针,建立实时荧光定量PCR检测方法。结果 建立的TaqMan-MGB探针具有良好的特异性,建立的荧光定量PCR标准曲线的循环阈值(Ct)与模板拷贝数呈良好的线性关系(r=0.99),灵敏性评估发现每个20 μlPCR反应管中只要有26个拷贝的目的基因即可被检测到,...
急性呼吸系统疾病暴发疫情多重巢式PCR检测分析
多重巢式PCR技术 肺炎衣原体 B型流感嗜血杆菌(HIB)
2014/8/11
对3起不明原因的聚集性急性呼吸系统疾病暴发疫情的标本进行多重巢式PCR检测,及时筛查SARS病毒、高致病性人禽流感H5N1亚型病毒并检测其他亚型流感病毒、副流感病毒、支原体、肺炎衣原体等病原体,探讨该方法在聚集性急性呼吸系统疾病调查中的应用意义。方法 采用多重巢式PCR方法对3起疫情的咽拭标本进行可引起急性呼吸系统疾病的23种病原体进行筛查。结果 医院甲不明原因肺炎聚集性病例9例,对9例咽拭标本进...
目的: 检测湖南省乙型肝炎病毒(HBV)基因亚型(Bj或Ba)的分布情况,了解基因亚型与HBV致病性的关系,希望以此诠释相同基因型HBV导致不同病情的机制. 方法: 随机选取经多对型特异性引物巢式PCR法鉴定为B基因型HBV的血清标本50例,包括慢性HBV携带者和慢性重型乙型肝炎患者各25例,采用巢式PCR-RFLP法鉴定其基因亚型(Bj或Ba). 结果: 50例B基因型HBV均为Ba亚型,没有发...
不可分群脑膜炎奈瑟菌PCR基因分型研究
不可分群 脑膜炎奈瑟菌 PCR
2010/3/30
目的对自健康人群鼻咽拭子中分离的74株表型特征为不可分群的脑膜炎奈瑟菌,利用PCR基因分型技术进行基因特征分析。方法用PCR方法扩增脑膜炎奈瑟菌种属特异性基因crgA和A、B、C、W135、Y、Z、X以及29E不同群的特异性基因片段,确定不同菌株的基因型。结果以脑膜炎奈瑟菌crgA基因为靶基因进行PCR扩增,74株不可分群脑膜炎奈瑟菌中,66株脑膜炎奈瑟菌crgA基因扩增阳性,检出率89.19%。...
套式/多重PCR方法应用于疟疾诊断与监测的初步评价
疟疾诊断 间日疟 恶性疟 套式/多重PCR
2009/4/7
目的 与镜检法比较评价标签引物-套式/多重PCR(UT-PCR)在疟疾监测中的应用价值。 方法 在海南、云南省恶性疟和间日疟混合流行区和广西疟疾控制区的疟疾监测中,采集初诊为疟疾或疑似疟疾的发热患者的血片与滤纸血样400份,在双盲条件下比较镜检法与UT-PCR的初检结果,对结果不一致的血片再次镜检复查,同时对其滤纸血样重复PCR 2~3次;评估UT-PCR与镜检法的敏感性和特异性。 结果 400例...
【摘要】 目的 提高标签引物?鄄套式/多重PCR诊断疟疾的敏感性、特异性与稳定性。 方法 用滤纸法采集非疟疾发热病人血样30份及其他传染病(感冒, 流感, 伤寒, 肝炎等)患者血样20份;抽取恶性疟和间日疟各1例患者血4 m1,进行系列稀释制备不同疟原虫含量的感染血样;健康者血样作对照。用热裂解法制备DNA模板,用线粒体细胞色素氧化酶基因作为靶基因,应用相关软件和网络资源(Primer Premi...
Detection of human papilomavirus types 16 and 18 in pathologic samples from patients with cervical cancer by PCR and RFLP methods
HPV Cervical cancer PCR Iran
2010/2/3
Infection with human papiloma virus (HPV) is the most frequent sexually transmitted disease worldwide. HPV types 16, 18, 31 and 33 are considered as the most important types in the cervical cancer.Thi...