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为了探讨ITS1作为分子标记用于鱼类系统演化的适用性,实验选取鲈形目5科11种鱼类为研究对象,包括尖吻鲈科、射水鱼科、军曹鱼科、剑鱼科和鲹科。通过克隆和测序等技术共获得了348条ITS1序列,长度范围为442~661 bp;通过对所有序列的长度、变异位点数量、GC含量、核苷酸多样性及单倍型多样性指数等遗传特征比较分析发现,11种鱼类ITS1序列论是在种内还是在种间,长度和序列都表现出较为明显的多态...
四川地区鸡异刺线虫核糖体转录间隔区(ITS1/2)序列的遗传变异分析
鸡异刺线虫 四川 ITS1/2 序列 遗传多样性
2016/4/29
探讨四川地区鸡异刺线虫(Heterakis gallinarum)的遗传变异情况,为该地区鸡异刺线虫病的流行特征及防控提供基础资料。采用PCR扩增四川7个地区共59个鸡源鸡异刺线虫核糖体ITS1-5.8S-ITS2片段并测序,所得序列剪切5.8S序列后,得到ITS1/2序列,并分析ITS1/2序列的遗传多样性;同时利用GenBank中已公布的异刺属(Heterakis)ITS1/2序列信息,进行系...
血卵涡鞭虫是一类寄生性的原生动物, 是近年来引起三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)、“牛奶病”及锯缘青蟹(Scylla serrata)“黄水病”的一种主要病原, 该虫对宿主感染时间长, 流行范围广、发病率、死亡率较高, 危害严重, 给梭子蟹和青蟹的养殖业造成了巨大的经济损失。近年来国内已对该寄生虫病原的生活史、形态学特征、感染途径、诊断及防治技术等方面进行了一些初步研...
通过对多种鸡球虫和松鼠球虫18S rRNA和28S rRNA进行序列比对分析,在18S rRNA 3′端和28S rRNA 5′端保守区设计艾美耳属通用引物,以斯氏艾美耳球虫洛阳分离株LY卵囊基因组DNA为模板首次成功克隆到斯氏艾美耳球虫完整的ITS15.8S rRNAITS2序列,其大小为1 178 bp,其中ITS1序列长度为423 bp,5.8S rRNA为155 bp,ITS2为600...
通过对多种鸡球虫和松鼠球虫18S rRNA和28S rRNA进行序列比对分析,在18S rRNA 3′端和28S rRNA 5′端保守区设计艾美耳属通用引物,以斯氏艾美耳球虫洛阳分离株LY卵囊基因组DNA为模板首次成功克隆到斯氏艾美耳球虫完整的ITS1-5.8S rRNA-ITS2序列,其大小为1 178 bp,其中ITS1序列长度为423 bp,5.8S rRNA为155 bp,ITS2为600...
Molecular Characterization of Fasciola hepatica Isolates by RAPD-PCR and Ribosomal ITS1 Sequencing
Fasciola hepatica RAPD-PCR Ruminant Iran
2015/9/22
Background: Understanding genetic structure and status of genetic variation of the Fasciola hepatica populations has important implications for epidemiology and effective control of fasciolosis. The a...
首次测定、分析了七种海洋纤毛虫(固着目、缘毛亚纲:团结蛤表单缩虫、拟杯状伪钟虫、糙面伪钟虫、倪氏聚缩虫、交替聚缩虫、羽状聚缩虫、中华拟聚缩虫)的rRNA转录间隔区-5.8S rRNA基因(ITS1-5.8S-ITS2)序列。结果显示:七种纤毛虫的5.8S区序列遗传相似度为0.9102—0.9811。ITS1和ITS2区的序列变异性大于5.8S区,遗传相似度分别为0.4201—0.9293,0.51...
双壳纲动物核糖体RNA 18S-ITS1序列及其在分子系统发育研究中的应用18S-ITS1 Sequence of rRNA in Bivalves and its Application in Phylogenetic Analysis
ITS1 18S RNA 遗传多样性 双壳纲
2008/1/20
摘要
测定了双壳纲不同科、属、种及种内共11个个体的核糖体RNA 18S-ITS1序列。结果表明,该序列在种间存在很高的多态性,长度从558 bp到784 bp不等,碱基差异百分比在10.7%~61.7%之间, ITS1序列同源性很低,有片段的插入与缺失。种间18S部分序列碱基差异百分比在0.9%~23.7%之间,变化主要是碱基的转换。用邻接法(NJ)构建了8个种的18S部分序列(约240 bp...
摘要:【目的】通过对美洲斑潜蝇Liriomyza sativae Blanchard 不同地理种群及近缘种间的核糖体DNA第一内转录间隔区(rDNA-ITS1)进行比较,分析美洲斑潜蝇不同地理种群间的遗传分化情况,并为美洲斑潜蝇与近缘种间提供分子鉴别标记。【方法】用PCR产物直接测序法及克隆测序法对我国美洲斑潜蝇8个地理种群的rDNA-ITS1序列进行测序,并调用GenBank中3个近缘种的rDN...
摘要:蓝氏贾第虫是广为关注的源真核生物,有人认为它处在生物进化中原核生物与真核生物间的过渡阶段,对其系统发育的研究具有重要的生物学意义。本研究通过对不同地域和/或宿主来源贾第虫虫株的核糖体基因(rDNA)的内转录间隔区(ITS1和ITS2)及5.8S rDNA序列进行扩增、克隆及序列测定,用NJ法构建分子系统树进行系统学分析。结果显示:所测得10个虫株的序列经用DNAMAN软件比对后,有2个虫株的...
摘要:黑脚硬蜱(Ixodes scapularis)是莱姆病的主要传毒媒介。本文利用从12个不同地点采集的853个样本,采用DNA单连构型多样性分子技术(DNA single strand conformation polymorphisms)对黑脚硬蜱的种群结构进行了分析。线粒体细胞色素b(Cyt b)和核糖体rRNA基因的内部转录空间ITS1被用为种群目标分子标记位点。在Cyt b位点上,总共...
海水鱼类寄生本尼登虫的ITS1序列
2007/7/28
期刊信息
篇名
海水鱼类寄生本尼登虫的ITS1序列
语种
中文
撰写或编译
作者
丁雪娟,李安兴,张剑英,廖翔华
第一作者单位
刊物名称
华南师范大学学报
页面
2003(2): 79-83.
出版日期
2003年
月
日
文章标识(ISSN)
相关项目
单殖吸虫重要类群的遗传标记及分子系统学
A New Primer Pair in ITS1 Region for Molecular Studies on Echinococcus granulosus
Primer design ITS1 DNASIS
2010/4/7
Background: Echinocuccus granulosus, the causative agent of cystic echinococcosis has long been recognized as having a
high degree of genetic divergence. The strains characterization seems to be esse...