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Identification of predicted genes expressed differentially in pituitary gland tissue of young growing bulls revealed by cDNA-AFLP technique
Bos taurus breeds differential display gene expression Hereford Limousine polyacrylamide gel electrophoresis restriction enzymes developmental ages real time PCR
2015/6/24
Differentially expressed transcript derived fragments (TDFs) of bovine pituitary gland tissue at different developmental ages of Limousine and Hereford bulls were identified by cDNA-AFLP technique. St...
棉纤维强度主要由棉纤维次生壁加厚期决定. 以陆地棉品种中棉所8号和海岛棉品种Pima90-53建立的包含109个单株的种间杂交F2群体为材料, 用cDNA-AFLP对棉纤维发育次生壁加厚期(20~25 DPA)基因表达谱进行剖析, 并构建了次生壁加厚期转录组图谱. 37对AFLP引物组合共检测到138个多态性表达片段(transcript-derived fragments, TDFs), 大小在...
以一个耐盐的二倍体野生种旱地棉和对盐敏感的陆地棉栽培种苏棉12号为材料，运用cDNA-AFLP技术，比较两个材料分别在盐胁迫前后的表达情况，获得了25个仅在旱地棉盐胁迫下特异表达的转录片段（TDF）。将这些片段进行电子克隆，延伸后的序列进行BLAST分析，结果显示23个转录片段推断的氨基酸序列与已知的蛋白同源，这些盐诱导表达的基因主要涉及离子转运、活性氧清除、细胞信号传导、细胞分裂、转录调节、膜保...
以陆地棉品系棕彩选1号为材料，利用cDNA-AFLP技术研究棉花低温处理前后基因表达的差异。试验采用64对引物组合进行扩增，共获得2321个条带，从中得到34条表达存在差异的条带。根据表达模式的不同，对其中表达存在差异的22个转录衍生片段(Transcripts derived fragments, TDFs)进行了克隆、测序和序列分析。结果表明：在低温胁迫条件下获得的18条TDFs中，上调表达2...
小麦cDNA- AFLP技术体系建立的研究
小麦 cDNA- AFLP 关键技术
2011/11/1
cDNA-AFLP是优秀的mRNA指纹图谱技术 ,具有可靠性强，多态检出率高等特点。利用这一技术，在不需要预先知道DNA序列信息的情况下就可以同时进行很多cDNA酶切片段的PCR扩增分析。本研究以小麦栽培品种为材料，对cDNA-AFLP技术的关键技巧作了研究和详细叙述，并建立起了该技术体系。
文心兰cDNA-AFLP体系的建立及TDFs分析
文心兰 cDNA-AFLP 引物筛选 TDFs
2013/9/6
通过总RNA提取、cDNA合成等试验,建立cDNA-AFLP分析体系。结果表明,采用MseⅠ和EcoRⅠ酶切3h,预扩增产物稀释15倍作为选择性扩增模板,利用筛选的引物进行扩增,可获得丰度和多态性较高的指纹图谱。利用59对引物获得约1160条TDFs (Transcription-derived fragments)。回收、克隆其中128条进行测序,获得102条可读序列,GenBank登陆号为JG...
茶树cDNA-AFLP银染技术体系的建立
茶树 cDNA-AFLP银染技术 体系建立
2011/9/1
为了挖掘安白茶白化期相关的差异基因，建立并优化了茶树叶片cDNA-AFLP扩增反应体系，进行cDNA-AFLP分析。在安吉白茶叶片cDNA-AFLP的试验中，分别对20 μL预扩增和选择性扩增反应体系中的4种反应条件影响因子进行不同梯度优化的研究，包括引物、Mg2+、dNTP及Taq DNA聚合酶的用量。PCR预扩增20 μL反应体系中，引物75 ng/20 μL，Mg2+ 2.0 mM，dNTP...
小麦抗叶锈近等基因系TcLr38的cDNA-AFLP分析
小麦叶锈病 Lr38 cDNA-AFLP 差异表达
2010/3/16
【目的】分析经叶锈菌诱导小麦抗叶锈近等基因系TcLr38的基因表达情况,寻找与抗病基因表达相关的片段。【方法】应用cDNA-AFLP技术从mRNA表达水平研究TcLr38和感病对照Thatcher与小麦叶锈菌05-22-65（THTS）互作时基因表达的差异。【结果】76对引物组合检测到约3 800条条带,平均每一对选择性引物可以获得50条条带,其中28对能够在小麦近等基因系TcLr38和感病对照T...
采用cDNA-AFLP技术，对成株抗条锈小麦品种兴资9104在成株期受条锈菌生理小种CY32侵染后5 d内9个时间点的基因表达谱进行了分析。共筛选64对引物，产生32 320个转录本(TDF)；用37对引物检测到2 201个(6.81%)差异TDF，其中926个TDF诱导表达，1 275个下调表达。经大规模克隆、测序分析，最终获得330个差异TDF，聚类分析得到259个EST (unigenes)...
以磷高效小麦品种石新828为材料，采用cDNA-AFLP技术，鉴定了短期(1~6 h)、中期(12~48 h)和长期(72~144 h)低磷胁迫根系特异上、下调表达基因的表达序列标签(EST)。共有非重复的上调ESTs 142个，下调ESTs 94个。胁迫下的前者分别含短、中和长期23、53和66个；后者分别含短、中和长期17、39和38个。对其功能比对发现，上调ESTs在功能上归属于信号转导、转...
沙冬青cDNAAFLP体系的建立及引物筛选
沙冬青 RNA提取 cDNA AFLP
2009/9/16
［目的］ 建立适合于沙冬青cDNAAFLP的反应体系。［方法］ 以对照、3种逆境处理的沙冬青为材料，采用Trizol法和改良CTAB法提取总RNA。［结果］ 改良的CTAB法可抽提到较高质量的总RNA，适于沙冬青总RNA的提取。采用EcoRⅠ/MseⅠ酶切体系,64对选择性扩增引物中有35对适合沙冬青cDNAAFLP分析。［结论］ 该研究为利用cDNAAFLP标记对沙冬青抗逆基因进行...
小麦抗叶锈近等基因系TcLr38的cDNA-AFLP分析
小麦叶锈病 Lr38 cDNA-AFLP 差异表达
2010/2/2
【目的】分析经叶锈菌诱导小麦抗叶锈近等基因系TcLr38的基因表达情况,寻找与抗病基因表达相关的片段。【方法】应用cDNA-AFLP技术从mRNA表达水平研究TcLr38和感病对照Thatcher与小麦叶锈菌05-22-65（THTS）互作时基因表达的差异。【结果】76对引物组合检测到约3 800条条带,平均每一对选择性引物可以获得50条条带,其中28对能够在小麦近等基因系TcLr38和感病对照T...
cDNA-AFLP法筛选红树植物盐应答基因
红树 耐盐性 基因分离 cDNA-AFLP
2009/3/2
【目的】分析红树植物盐胁迫下基因表达谱，分离识别耐盐相关基因。【方法】分别对红树植物-秋茄进行海水和淡水处理。分时提取总RNA进行等量混合，获得两种不同处理的样品池。采用cDNA-AFLP技术进行表达差异分析。【结果】256对引物组合共筛选了约15 000个cDNA片段，获得差异片段61个。差异基因表达模式分为2类，即海水处理诱导上升和下调表达，其中上升表达的基因片段为36个，下调表达的基因片段为...
高温胁迫下番茄叶片差异表达基因的cDNA-AFLP鉴定
番茄 高温胁迫 cDNA-AFLP 差异表达基因
2009/2/10
为鉴定番茄高温胁迫响应基因，应用cDNA-AFLP技术，以番茄耐热品系Saladette幼苗为研究对象，对高温胁迫早期叶片基因表达进行了mRNA指纹分析。通过768对引物组合的筛选，共分离得到187个差异表达的转录衍生片段(TDF)，其中增强表达或高温胁迫下特异性表达TDF153条，抑制表达34条。对其中47个TDF进行了克隆、测序和序列分析。结果表明：34个TDF与NCBI或TIGR已有序列同源...