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SELDI蛋白质芯片技术在肝癌研究中的进展
SELDI蛋白质芯片技术 蛋白质组学 肝细胞癌
2010/10/15
SELDI蛋白质芯片技术是一种快速、简便易行和高通量的蛋白质组学研究方法，在肝癌研究中具有广阔的应用前景。本文就其技术原理、临床应用作一综述。
基因芯片筛选抗胸腺细胞血清性肾炎大鼠肾组织基因表达差异的初步研究
肾炎 基因表达 寡核苷酸序列分析
2009/8/25
目的： 利用基因芯片检查大鼠系膜增生性肾炎，即抗胸腺细胞血清性肾炎(ATSN)模型大鼠发病 40 min 和 5 d 时肾组织相关基因的表达情况，探讨ATSN大鼠不同时相肾组织基因表达的差异并作功能分析。 方法： 用抗胸腺细胞抗血清（ATS）复制大鼠ATSN模型，抽提发病 40 min 和 5 d 时肾组织RNA，分别用逆转录合成荧光分子掺入的cDNA作探针进行基因芯片杂交。用Agilent 扫...
目的： 抗体蛋白质芯片初步筛选常见细胞因子在卵巢癌耐药细胞株中的表达。 方法： 对6株卵巢癌细胞分别进行平行药敏试验及细胞因子抗体蛋白质芯片检测，同时筛选78种细胞因子的表达差异，并进行两两比较。 结果： 不同种类卵巢癌细胞系对于ADM的IC50值从高到低前3位依次为SKOV3，OVCAR5，OVCAR4；CBPDA为IGROV1，SKOV3，OVCAR3；TAXOL为OVCAR4，SKOV3，I...
应用基因表达谱芯片筛选胃腺癌相关基因
胃腺癌 基因表达谱芯片 差异表达基因
2009/8/10
目的: 利用基因芯片技术筛选胃腺癌组织和癌旁正常组织间的差异表达基因. 方法: 分别抽取胃腺癌组织和癌旁正常组织的总RNA. 采用逆转录的方法, 制成cDNA链, 并以两种荧光Cy5和Cy3标记后作为探针, 与含有14 784条人类14KcDNA基因表达谱芯片进行杂交. 以Agilent荧光扫描仪扫描芯片上两种荧光信号, 并用计算机处理和分析. 结果: 在14 784条基因中, 4例胃腺癌组织和...
利用组织芯片技术研究COX-2在胃癌中的表达及其与血管生成的关系
胃癌 环氧合酶 组织芯片 微血管密度
2009/8/7
目的: 研究COX-2在胃癌中的表达及其与血管生成的关系, 探讨其在胃癌转移中的作用及与胃癌病理生物学行为的关系. 方法: 采用EnVision方法检测胃癌组织芯片中COX-2的表达, 用CD34进行微血管内皮细胞染色, 计算微血管密度(MVD), 分析其相关性. 结果: COX-2在胃癌中的表达明显高于正常胃黏膜(P = 0.001). COX-2的高表达与胃癌的转移(P = 0.019)和胃壁...
因芯片数据分析的目的就是从看似杂乱无序的数据中找出它固有的规律, 本文根据数据分析的目的, 从差异基因表达分析、聚类分析、判别分析以及其它分析等角度对芯片数据分析进行综述, 并对每一种方法的优缺点进行评述, 为正确选用基因芯片数据分析方法提供参考.
应用基因芯片研究肾移植急性排斥中外周血淋巴细胞免疫相关基因变化
肾移植 移植物排斥 淋巴细胞 基因表达
2009/8/5
目的：借助基因芯片研究肾移植受者外周血淋巴细胞在急性排斥的免疫应答中的作用。 方法： 8例肾移植术后发生急性排斥反应患者，于手术和肾穿刺当日收集外周血作为对照血样和实验血样。用Ficoll技术提取外周血淋巴细胞，并采用一步法提取总RNA，逆转录合成cDNA探针, 荧光染料标记后，采用免疫相关基因芯片进行芯片杂交，扫描后筛选出差异表达基因。 结果： 急性排斥发生时外周血淋巴细胞免疫相关基因差异表达4...
试论影响基因芯片实验设计的因素
影响 基因芯片 实验设计
2009/8/3
良好的基因芯片实验设计是充分发挥基因芯片技术优势的前提，而研究目的是实验设计的基础.本文介绍了参照、平衡和环形三种常用的单因子、时间序贯和复因子等基本的基因芯片实验设计方案;探讨了重复实验、混合样本和样本规模等影响基因芯片实验设计的因素，为基因芯片实验设计提供参考.
蛋白质芯片在肿瘤以及恶性腹水诊断中的应用
蛋白质芯片 肿瘤 恶性腹水诊断
2009/8/3
腹水是一种临床常见病症，病因复杂，其病因诊断尤其是良、恶性腹水的鉴别具有重大意义.蛋白质芯片是近年来新兴起的生物学技术，具有高通量、高敏感性和高特异性的特点，可同时分析多个生物标本或检测多种疾病，被广泛应用于医学研究.本文介绍了蛋白质芯片基本原理、临床应用，尤其在肿瘤标志物的筛选和良、恶性腹水的鉴别诊断方面的研究进展.
目的: 运用SELDI蛋白质芯片技术检测体外培养的肝癌细胞株(HepG2)与转染乙肝病毒的肝癌细胞株(HepG2.2.15)蛋白质的差异表达，从而为进一步研究肝癌的发病机制奠定基础. 方法: 常规培养上述两种细胞，细胞状态良好时收集细胞，裂解细胞后采用 SELDI-TOF-MS技术用WCX2芯片检测HepG2、HepG2.2.15蛋白质组学的差异. 结果: WCX2芯片共捕获91个蛋白，其中Hep...
应用基因表达谱芯片技术筛选NS4ATP2蛋白反式调节基因
基因表达谱芯片技术 NS4ATP2蛋白 反式调节基因
2009/7/31
目的: 对丙型肝炎病毒非结构蛋白4A(HCV NS4A)反式激活新基因NS4ATP2转染肝癌细胞的基因表达谱进行分析，探索该基因表达对肝细胞基因表达的调节机制及其生物学功能. 方法: 应用基因表达谱芯片技术对重组表达质粒pcDNA3.1(-)-NS4ATP2和pcDNA3.1(-)空载体分别转染的HepG2细胞的mRNA的差异性表达进行检测. 结果: 基因表达谱芯片所检测的1152条目的基因均为G...
组织芯片技术检测食管癌前病变相关预警标志物
组织芯片技术 食管癌前病变 预警标志物
2009/7/30
目的: 检测annexin I，Grp94，p53，Ki-67四种侯选肿瘤标志物在食管癌及癌前病变中的表达情况，为食管癌的早期检测提供依据.方法: 72例单纯手术切除食管鳞癌及其癌旁伴有的不同程度癌前病变，构建组织芯片;应用免疫组化方法检测annexin I，Grp94，突变型p53，Ki-67蛋白在食管鳞癌及不同程度癌前病变中的表达差异.结果: 四种蛋白在食管癌前病变中均有异常表达，与正常鳞状上...
基因表达谱芯片筛选双环醇作用HepG2细胞后的差异表达基因
基因表达谱芯片 筛选 双环醇作用 HepG2细胞
2009/7/29
目的: 应用基因表达谱芯片技术了解双环醇在肝细胞中可能上调或下调的基因，了解其可能的调节功能线索.方法: 以双环醇处理HepG2细胞，同时以二甲基硫氧化物(DMSO)处理的相同细胞系作为对照; 24 h后制备细胞裂解液，提取mRNA.应用基因表达谱芯片技术对差异表达mRNA进行检测和分析.结果: 经基因表达谱芯片分析，12种基因的表达水平上调，9种基因的表达水平下调.结论: 筛选到的一些与细胞周...
目的: 应用基因芯片技术，检测丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活基因1(NS3TP1)的表达对肝母细胞瘤细胞HepG2基因表达谱的影响，进一步NS3TP1蛋白可能的分子生物学功能.方法: 设计并合成NS3TP1基因序列特异性的引物，应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增NS3TP1蛋白编码基因片段，以常规的分子生物学技术构建表达载体pcDNA3.1(-)-NS3TP1. 以脂质体技术...