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Class prediction by nearest shrunken centroids,with applications to DNA microarrays.
Class prediction nearest shrunken centroids DNA microarrays
2015/8/21
Class prediction by nearest shrunken centroids,with applications to DNA microarrays..
一种新型的DNA荧光染料-DAPI的光学特性及其应用。
基于贝叶斯网络的DNA序列剪接位点预测
贝叶斯网络(Bayesian network) 剪接位点(Splice junction site) 供体位点(Acceptor site) 受体位点(Donor site)
2008/3/7
采用基于贝叶斯网络的建模方法,预测真核生物DNA序列中的剪接位点。分别建立了供体位点和受体位点模型,并根据两种位点的生物学特性,对模型的拓扑结构和上下游节点的选择进行了优化。通过贝叶斯网络的最大似然学习算法求出模型参数后,利用10分组交互验证方法对测试数据进行剪接位点预测。结果显示,受体位点的平均预测准确率为92.5%,伪受体位点的平均预测准确率为94.0%,供体位点的平均预测准确率为92...
k-长DNA子序列频数分布研究
DNA序列(DNA Sequences) 三维频数分布图(3D Frequency Distribution Map) 分形(Fractal) 非中心F分布(Non-central F Distribution) k-长DNA子序列(k-mer)
2008/3/5
在详细阐述了生成DNA序列分形图像的Hao方法后,提出一种能够直观显示k-长DNA子序列频数分布差异性的三维频数分布图生成方法。把3D频数分布图转化为1D对数频谱图,突出显示了频数分布的局部特征,提出k-长DNA子序列频数区划分准则,并详细研究了甚高频数区的n阶零间隔现象,指出n阶零间隔分布就是基因组进化过程所留痕迹的假设,并给出对数频谱图特征的生物学解释。实验发现许多DNA序列频数概率分布近...
介绍了一门新的科学领域─DNA计算的一些基本概念和基础知识,并提出了一些创造性的看法,而且给出了一些新的结论。主要从以下几个方面叙述:DNA计算的常用操作、DNA计算的几种形式化模型、并以其中一种模型为例证明了DNA计算的完备性和通用性,还介绍了DNA计算的重要机制,自装配的基本概念及自装配常用分子,并给出了一些常用分子的自装配与形式语言产生过程的对应,证明了双链分子的自装配能够产生于线性语言对应...