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河南省烟草黑胫病菌群体遗传结构的SSR分析
烟草黑胫病菌 SSR 遗传多样性 遗传结构
2018/12/17
为明确河南省烟草黑胫病菌群体的遗传结构，本研究利用SSR分子标记对来自河南省12个地区的32株烟草黑胫病菌进行分析。结果显示，6对SSR引物共扩增出24个条带，其中多态性条带23个，多态性条带比率为95.83%；Nei’s基因多样性指数和Shannon信息指数分别为0.2132和0.3356；遗传相似系数在0.61~1.00之间，相似系数0.80水平下UPGMA聚类可将32个菌株划分为5个类群，其...
为分析我国晒烟种质资源的遗传多样性，并构建晒烟种质资源的指纹图谱，本研究利用25对SSR标记对33份晒烟材料进行分析。结果表明，25对SSR引物共检测到112个等位基因，平均每个标记4.31个，观测杂合度（Ho）平均值为0.0028，预期杂合度（He）平均值为0.6039。Shannon's信息指数I为1.1389，Nei's多样性指数（H）为0.5693，33份晒烟种质资源的遗传多样性相对丰富。...
本文旨在分析烤烟种质资源遗传多样性，通过关联分析寻找与烤烟农艺性状和化学成分相关联的分子标记，为分子标记辅助选择育种和提高烤烟育种效率奠定基础。利用均匀分布于烟草24个连锁群上的120个SSR标记分析了231份烤烟种质资源的遗传多样性及群体遗传结构，在此基础上采用TASSEL 5.0 GLM（general linear model）和MLM （mixed linear model）方法进行标记与...
基于RAD-seq数据开发烟草多态性SSR标记
烟草 RAD-seq SSR标记 多态性
2019/8/14
采用RAD-seq技术对两份烟草材料"118-3"和"粤烟98"进行简化基因组测序，分别获得45 119 346和50 360 738个高质量干净读长（HQ clean reads）。通过序列分析，在22 145个reads覆盖的参考基因组序列中共检测到25 343个SSR位点，其中以二和三核苷酸重复基序最为丰富，占总SSR位点的71.59%；除单核苷酸类型外，SSR基序的重复次数主要集中在4~9...
“一个与烟草TMV抗性基因N紧密连锁的共显性SSR标记”研究揭示，1对SSR引物TM508-007扩增出的标记与TMV抗性的N基因紧密连锁，该标记稳定可靠，可用于烟草抗TMV分子标记辅助选择。该成果发表在《中国烟草学报》2017年第2期上。
一个与烟草TMV抗性基因N紧密连锁的共显性SSR标记
烟草 烟草花叶病 分离集团分组分析法 共显性SSR标记
2018/6/6
烟草普通花叶病（Tobacco Mosaic Virus，TMV）是烟叶生产的主要病害，为建立烟草抗TMV分子标记辅助选择体系，本研究以高抗TMV烤烟品种Coker176和易感TMV烤烟品种Y3以及它们的BC1F1群体为试材，采用分离集团分组分析法（Bulked Segregation Analysis，BSA）和简单序列重复（Simple Sequence Repeat，SSR）标记技术，筛选与...
科研人员通过进行“烤烟种质资源SSR核心引物的筛选及验证”研究，从分布于烟草24条连锁群上的2317对SSR引物中筛选出24对核心引物，经验证，适用于烤烟种质资源鉴定和遗传多样性分析。该结果于10月28日发表在《中国烟草科学》2016年第5期上。
A SMALL LOW EQUATORIAL ORBITING SATELLITE - SSR FOR MONITORING THE AMAZON REGION
Vegetation Monitoring Small/micro satellites Sensor Multitemporal Optical Proposal
2015/5/12
Frequent cloud cover over the Amazon region is the greatest limitation to monitor, via optical remote sensing systems, ongoing
activities that are threatening the greatest rainforest of the world. Cu...
烟叶致香物质是烤烟品质及香型风格的物质基础，是烟草品质改良的重点之一。本研究采用气相色谱方法，对11份不同香型风格的烟草种质进行了52种致香成分的检测，同时采用1条高密度连锁群上的62个SSR位点对其进行了分子标记位点分型。通过标记-性状关联分析，发掘到17种烟草致香物质的24个关联位点。大多数位点关联到了多种致香成分。对供试材料的连锁不平衡分析，发现该连锁群存在2个单倍型，单倍型tsHap1_1...
一个与净叶黄抗赤星病基因紧密连锁的SSR标记
烟草 净叶黄 SSR 赤星病
2015/8/26
为了在分子水平上弄清烟草赤星病抗性的遗传规律,并进行遗传定位,以抗赤星病品种净叶黄和感赤星病品种NC82为亲本,构建了F1、F2、BC1 代群体。通过对该群体进行赤星病接种鉴定和抗性遗传分析,发现净叶黄对赤星病的抗性由显性多基因控制。通过分子标记群体扩增,在第M号连锁群上,筛选到一个与净叶黄的赤星病抗性基因紧密连锁的SSR标记,它与抗性基因间的遗传距离为4 cM。该标记可用于抗赤星病育种的辅助选择...
普通烟草种质资源的SSR标记与指纹图谱分析
烟草 SSR 指纹图谱构建 品种鉴定
2015/8/21
利用SSR标记构建了烟草核心种质中80份普通烟草种质的指纹图谱。从286对SSR引物中筛选出8对多态性较好的引物，对这些烟草种质进行分析，共检测到 85个多态性位点。研究表明，这8对多态性SSR引物可以将80份烟草种质完全区分开，每份种质都有各自独特的指纹图谱，表明SSR标记完全适用于普通烟草种质鉴定和指纹图谱构建工作。
烟草SSR荧光标记与毛细管电泳检测技术研究
SSR 毛细管电泳 荧光标记检测 CEQ8000遗传分析系统
2015/8/21
将毛细管电泳荧光检测技术应用于烟草SSR标记分析，以期借助自动化、智能化的仪器设备加速对烟草遗传分析的研究进程。采用毛细管电泳荧光检测技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，对9份烟草材料进行SSR位点分析，用相同的材料和引物，对这两种方法的检测结果进行比较，建立并优化了毛细管电泳荧光检测法应用于烟草SSR标记分析的技术体系。结果表明,荧光检测法克服了银染法的不足，具有简便、可靠及高通量的优点。同时对微卫星...
同科植物SSR引物在烟草遗传差异分析中的应用研究
烟草 SSR标记 遗传差异
2015/8/21
为丰富分子标记类型，加速烟草种质资源遗传多样性的研究利用，从番茄、辣椒的SSR引物中选择22对SSR引物，用遗传差异较大的14个烟草材料筛选引物，应用筛选出的引物对24份烤烟材料进行扩增，分析其遗传差异性。22对SSR引物中筛选出8对重复性好、多态性高的引物。8对引物在24份烤烟材料中共检测到98条遗传多态性带，引物多态信息量变化范围为0.451～1，平均0.646。品种间的遗传相异系数变异范围为...
绒毛状烟草基因组中SSR位点的信息分析
绒毛状烟草 简单重复序列 基元
2015/8/21
通过SSRFINDER软件搜索绒毛状烟草基因组DNA，设置条件是重复单元长度2~5 bp，重复次数10～60，共找到6 441个SSR位点，涉及5 227个Scaffold，SSR序列总长为303 963 bp，约占全基因组的0.12‰，即绒毛状烟草基因组中平均每400 kb会出现一个SSR位点。在所有SSR位点中，二、三碱基重复基元分别占总数的45.2%和49.6%，重复单元的重复次数10～20...