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用地衣红-卡红染色进行共生菌的形态观察,鉴定棘阿米巴CB/S1内共生细菌。克隆内共生细菌的16S rDNA基因,进行基因序列分析。结果表明,经地衣红-卡红染色棘阿米巴CB/S1内共生细菌呈黑色和棒状,在胞质内不规则分布。棘阿米巴CB/S1内共生细菌的16S rDNA基因长1 534 bp,与类亚洲嗜阿米巴杆菌(Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2)和韩国棘阿米...
中国不同地区蛇床的rDNA ITS序列分析
蛇床 rDNA内转录间隔区 纬度
2010/1/12
目的:探讨不同分布区的蛇床Cnidium monnieri的ITS序列变异与其地理分布和化学成分的相关性。方法:设计2对引物,Pf+Pb及P5.8S ITS1+P5.8S ITS2,PCR扩增产物纯化后用银染法或ABI 310测序。结果:得到核糖体DNA中的ITS及5.8S rDNA完全序列,18S和26S rDNA部分序列,共约700 bp。5个地点样品的ITS-1及ITS-2的序列大小分别为2...
Single Strand Conformation Polymorphism analysis of PCR-amplified rDNA to differentiate medically important Aspergillus Species
SSCP Aspergillus Identification PCR
2009/12/9
Background: Aspergillus species are associated with allergic bronchopulmonary disease, mycotic keratitis, otomycosis, nasal sinusitis and invasive infection. In this study, we developed a PCR-Sin...
不同地区微小按蚊rDNA-ITS2序列差异
微小按蚊 核糖体DNA 第2内转录间隔区 序列
2009/2/25
目的 比较我国云南、海南省、广西壮族自治区及泰国等不同地区微小按蚊核糖体 DNA第 2内转录间隔区 ITS2 )序列差异。 方法 取单只雌蚊蚊腿消化提取 DNA,PCR特异扩增 r DNA- ITS2片段 ,并对其扩增产物纯化、测序及分析。 结果 发现 2种不同的 ITS2序列 Gen Bank登录号 :AF4 16 783,AF4 16 784 ) ,分别与微小按蚊 A和 C同源 ,ITS2序列...
从吉林延边地区土壤中分离的棘阿米巴属CJY/S1和CJY/S2株中提取基因组18S rDNA,PCR扩增、克隆、测序后用分子生物学软件Clustal X进行序列分析,与基因库中已有T1至T12型序列进行比较并构建进化树。结果棘阿米巴土壤分离株Acanthamoeba sp. CJY/S1和CJY/S株的18S rDNA全基因序列分别为2 255 bp和2 252 bp,均属T4基因型。
广西两地旋毛虫分离株5S rDNA序列分析
旋毛虫 5S rDNA 基因 分离株
2009/2/24
目的 应用5S rDNA序列分析,鉴定广西德保、南丹两地旋毛虫分离株。 方法 PCR扩增2个分离株5S rDNA片段,并对扩增产物进行测序;用相关软件分析序列的同源性、遗传距离,同时构建系统发生树,并与GenBank中旋毛虫相应基因序列进行比较。 结果 广西德保、南丹2地旋毛虫分离株和GenBank中Trichinella spiralis的5S rDNA碱基序列长度相同,为695 bp;变异位点...
目的 探讨牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫(Orientobilharzia turkestanicum)核糖体内转录间隔区(ITS)和28S核糖体大亚基序列(rDNA-LSU)的差异。 方法 粪便检查、剖杀自然感染东毕吸虫的绒山羊、山羊、绵羊和黄牛,收集虫体,形态学鉴定为土耳其斯坦东毕吸虫。抽提成虫基因组DNA,扩增其ITS(包括ITS-1、5.8S rDNA和ITS-2)和28S rDNA-LSU序列...
[目的 ]论证昆明按蚊 (Anopheles kunmingensis)和凉山按蚊 (An. liangshanensis)的分类地位。 [方法 ]比较两种按蚊 r DNA- ITS2序列差异和主要形态特征的变化幅度。 [结果 ]两种按蚊 8个样本 r DNA- ITS2序列同源性为 97.1%~ 99.8%。昆明按蚊雌蚊翅 V5 .2缘缨白斑、后跗 基白环 (斑 )及幼虫头毛 2 - C具叉枝等...
中国大陆两种东毕吸虫rDNA-LSU基因的序列分析
rDNA-LSU 东毕吸虫 序列分析
2009/2/17
目的 测定程氏东毕吸虫、土耳其斯坦东毕吸虫结节变种rDNA LSU基因序列 ,并对照已发表的土耳其斯坦东毕吸虫同一基因序列 ,比较三者的差异 ,探讨东毕吸虫虫种分类问题。 方法 收集两虫种成虫 ,GNT K法抽提基因组DNA ,PCR扩增目的基因 ,并将其产物克隆入质粒再次扩增 ,提取质粒DNA ,以M 13(F/R)作为测序引物进行测序。从GenBank获得土耳其斯坦东毕吸虫rDNA LSU基因...
枫斗类石斛rDNA ITS区的全序列数据库及其序列分析鉴别
石斛属 枫斗类石斛 rDNA ITS区全序列 DNA分子鉴别
2010/1/18
目的建立枫斗类石斛的rDNA ITS区碱基全序列数据库,利用该数据库对枫斗类石斛待检种进行准确鉴别。方法对枫斗类石斛的rDNA ITS区进行了PCR扩增、测序,运用CLUSTRAL,MEGA等软件以及枫斗类石斛rDNA ITS区全序列数据库对待检种rDNA ITS区进行序列分析鉴别。结果建立了21种枫斗类石斛的rDNA ITS区全序列数据库, 枫斗类石斛在该区的种间差异显著而稳定,转换和颠换总数为...