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中山大学医学院丁俊军教授团队关于相分离通过调控染色质三维结构重组促进细胞命运转变的研究在《Cell Stem Cell》发表
丁俊军教授；相分离；调控染色质；三维结构；促进细胞命运
2021/9/26
真核细胞染色体通常会有序的折叠，在空间上会形成有序的三维结构。这些三维结构由大到小主要分为区室分隔（compartments）、拓扑相关结构域（Topological-Associated Domains,TADs）以及染色质环状结构（loops）等。细胞命运转变过程中往往伴随着染色体三维结构的剧烈变化，而这些变化对于推动细胞命运转变的进行起到重要作用。TAD通常被认为是一种相对保守的结构，在不同...
细胞内广泛存在相分离（Phase Separation）现象，成千上万的蛋白或核酸分子在复杂的细胞内部形成一个一个无膜“隔间”，就像油滴在水中一样，彼此互不干扰地参与细胞内如转录调控、应激、蛋白质质量控制、DNA复制等多种重要的生物学过程。1,6-己二醇（1,6-HD）是一种能够使得相分离液滴溶解的化学小分子，它是目前唯一的能同时破坏多种相的工具，所以非常有潜力应用于研究全局层面上相分离现象与其他...
中国科学院广州生物医药与健康研究院发现RNA调控染色质的新机制（图）
RNA调控 染色质 新机制 异染色质
2021/3/9
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组研究发现RNA m6A修饰调控异染色质形成的新机制，阐明RNA m6A阅读器YTHDC1在这一机制中的关键作用：抑制基因组中广泛分布的ERVK、IAP、LINE1等转座元件，限制胚胎干细胞向全能性干细胞转化，相关研究论文以The RNA m6A reader YTHDC1 silences retrotransposons and guards ...
登上《自然》主刊！复旦大学生物医学研究院表观团队揭示METTL3调控小鼠胚胎干细胞异染色质形成机制（图）
复旦大学生物医学研究院 METTL3 调控 小鼠胚胎干细胞异染色质形成机制
2021/2/23
如果说基因携带着遗传的“密码”，那么当RNA被甲基团修饰时就如同戴上了一件装饰品，因其调控作用而使“解密”后呈现的“模样”并不完全对应最初的“密码”。RNA被甲基团修饰的结果便是“甲基化”，是表观遗传的重要信号之一。RNA m6A甲基化是近年来RNA领域的研究热点。RNA产生于染色质，染色质环境的维持对于基因组稳定十分重要。在基因组的冷冻区，在这个人们通常认为是“沉默”的区域，是否也有“甲基化开关...
复旦大学生物医学研究院、上海市医学表观遗传学重点实验室青年研究员沈宏杰和牛津大学教授Yang Shi合作研究，发现METTL3通过调控内源性逆转录病毒（Endogenous retrovirus）IAPEz亚群上的异染色质状态，进而抑制IAPEz元件转录，即发现RNA m6A对于沉默基因组稳定性的重要调控功能。1月27日，相关研究成果以《METTL3调控小鼠胚胎干细胞异染色质》（“METTL3 r...
清华大学医学院李海涛团队在异染色质组蛋白二价修饰读码研究中取得突破（图）
异染色质 组蛋白 二价修饰读码
2020/12/17
2020年12月4日，清华大学医学院李海涛教授课题组针对此问题在《生物化学期刊》（Journal of Biological Chemistry）发表了最新研究成果：“Spindlin1识别组蛋白二价修饰H3”K4me3-K9me3/2”的分子基础”（Molecular basis for histone H3 “K4me3-K9me3/2” methylation pattern readout...
重庆医科大学基础医学院向云龙教授在《Nature Genetics》发文揭示胚胎多能性谱系独特的染色质状态及其分子机制与功能（图）
重庆医科大学基础医学院 向云龙 教授 Nature Genetics 胚胎多能性谱系 染色质 分子机制 功能
2019/12/24
向云龙教授为我校2019年新引进的特聘教授-骨干人才，他在清华大学攻读博士期间的一项工作以“Epigenomic analysis of gastrulation identifies a unique chromatin state for primed pluripotency”为题，发表于2019年12月17日的《NatureGenetics》杂志上。该研究通过多种小量化染色质表观遗传学分析...
《Molecular Therapy》发表上海交通大学医学院附属第九人民医院范先群团队揭示lncRNA ROR染色体构象调控葡萄膜黑色素瘤发生新机制（图）
上海交通大学医学院 范先群 lncRNA ROR 染色体 构象调控 葡萄膜 黑色素瘤 发生新机制
2019/9/9
最近美国基因和细胞治疗学会官方杂志《Molecular Therapy》发表上海交通大学医学院附属第九人民医院范先群教授团队研究成果“A Cohesin-Mediated Intrachromosomal Loop Drives Oncogenic ROR lncRNA to Accelerate Tumorigenesis”。该研究揭示了长链非编码ROR(lncRNA-ROR)通过形成染色体内环...
探讨羊水细胞染色体检测结果与产前诊断指征的关系，以及不同的产前诊断检测技术在临床的应用价值，为产前遗传咨询提供客观临床数据。方法2016年11月至2018年11月接受羊膜腔穿刺产前诊断的孕妇共448例，其中瘢痕子宫87例，同时采用染色体G显带技术分析和分子生物学技术，根据不同的产前诊断指证，选用细菌人工染色体微珠（BoBs）、CGX寡阵（CGXOligoarrays）8×60K或染色体微阵列分析（...
浙江大学医学院陈宝惠课题组在Nature Communications上发表活细胞染色质成像新方法（图）
浙江大学医学院 陈宝惠 课题组 Nature Communications 活细胞染色质 成像新方法
2018/12/3
2018年11月29日，Nature Communications在线发表了浙江大学医学院陈宝惠课题组题为Efficient labeling and imaging of protein-coding genes in living cells using CRISPR-Tag的研究论文。该研究提出了一个新的非重复DNA序列的标记策略，在活细胞内实现了特异蛋白编码基因DNA元件与蛋白的高效双标记...
上海交通大学医学院程金科研究组发现去SUMO化酶SENP3在调控细胞分裂和染色体稳定中的新功能（图）
上海交通大学医学院 程金科 研究组 去SUMO化 酶SENP3 细胞分裂 染色体
2018/5/17
生物化学与分子细胞生物学系程金科研究员实验室在国际知名学术期刊Cancer Research（影响因子9.1）上发表了题为“Mitotic Phosphorylation of SENP3 Regulates DeSUMOylation of Chromosome-Associated Proteins and Chromosome Stability”的研究论文，报道了他们最新的有关去SUMO化...
复旦大学基础医学院/生物医学研究院文波课题组解析核基质蛋白HNRNPU对染色质高级结构的调控作用（图）
复旦大学基础医学院/生物医学研究院 文波课题组 核基质 蛋白HNRNPU 染色质 高级结构 调控作用
2018/1/3
复旦大学基础医学院和生物医学研究院双聘PI文波研究员课题组在核基质蛋白对染色质高级结构的全局性调控作用研究方面取得重要进展，相关研究成果于12月22日以《核基质蛋白HNRNPU在小鼠肝细胞中维持3D基因组全局结构》（The nuclear matrix protein HNRNPU maintains 3D genome architecture globally in mouse hepatoc...
信息时代是计算机语言的二进制码（0-1）驱动的，0与1二进制演绎出丰富多彩的虚拟世界，包括热门的人工智能AI。那么，生命科学是否也存在类似的0-1二进制规律的密码？中国科学院广州生物医药与健康研究院裴端卿课题组、陈捷凯课题组，通过对干细胞命运诱导过程的研究，发现细胞命运转换也遵循一个二进制规律。科学家通过对染色质的开放与关闭的研究，发现在体细胞诱导为干细胞时，染色质与细胞变化有关的位置存在一个“开...
2017年10月12日，中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组以Gadd45a opens up the promoters regions of miR-295 facilitating pluripotency induction为题的研究论文，在线发表在Cell Death and Disease上。研究人员发现在体细胞重编程为诱导多能干细胞过程中，异染色质松散因子Gadd45a特异...
近日，德克萨斯州西南医学中心的徐剑教授课题组与复旦大学附属中山医院及生物医学研究院（IBS）周峰研究员课题组合作，首次利用了“biotinylated dCAS9”的方法建立了高分辨率，位点特异原位DNA-蛋白质以及其他元件的互作网络 。8月24日，相关研究成果以《通过dcas9原位捕捉染色质相互作用网络》（“In Situ capture of chromatin interactions by...