搜索结果: 1-15 共查到“知识库 作物学 RNA”相关记录58条 . 查询时间(0.109 秒)
Gossypol Broadly Inhibits Coronaviruses by Targeting RNA-Dependent RNA Polymerases
棉花 次生代谢物 棉酚 抑制冠状病毒
2024/4/16
研究团队以SARS-CoV-2为实验模型，采用计算机高通量筛选、酶学验证、抗病毒实验和冷冻电镜表征等多学科交叉的方式，从棉花中筛选到一种重要的次生代谢物——棉酚，发现棉酚能够广谱抑制冠状病毒。研究结果开辟了多学科交叉和多元化利用新方向，对促进棉花天然产物的研究和利用、拓宽棉花副产品的价值链具有重要意义。
Comprehensive review and assessment of computational methods for predicting RNA post-transcriptional modification sites from RNA sequences
N1-甲基腺苷 N6-甲基腺苷位点 计算方法
2024/5/17
对27种预测N1-甲基腺苷和N6-甲基腺苷位点的最先进方法的全面综述，涵盖了对开发成功预测器至关重要的各种重要方面，包括数据集质量、操作算法、序列和基因组特征、特征选择、模型性能评估和软件效用。同时提出了一种基于深度学习技术的计算方法DeepPromise，用于同时预测N1 -甲基腺苷和N6 -甲基腺苷。开发了一个web服务器，该服务器可以接受RNA序列和基因组序列，以预测两种假定的RNA修饰位点...
An integrated platform and meta-learner for feature engineering machine learning analysis and modeling of DNA, RNA and protein sequence data
python 工具包 蛋白质序列
2024/5/17
一个全面和通用的基于python的工具包，集成了特征提取、聚类、归一化、选择、降维、预测器构建、最佳描述符/模型选择、集成学习和DNA、RNA和蛋白质序列结果可视化的功能。用户只需要上传自己的数据集，并从中计算出自己需要的功能，所有必要的程序和优化设置都由软件自动完成。iLearn包括DNA、RNA和蛋白质的各种描述符，支持四种特征输出格式，以便于直接使用输出或与其他计算工具通信。总的来说，iLe...
Development of marker-free rice with stable and high resistance to rice black-streaked dwarf virus disease through RNA interference
marker-free rice black-streaked dwarf virus disease RNA
2023/8/9
The rice black-streaked dwarf virus (RBSDV) disease causes severe rice yield losses in Asia. RNA interference (RNAi) has been widely applied to develop antiviral varieties in plants. So far, only a fe...
水稻OsRPK1基因属于富含亮氨酸重复序列的类受体蛋白激酶, 在盐胁迫下其表达量暂时升高后出现明显下降。前期研究表明, OsRPK1基因过表达会造成拟南芥非生物胁迫耐受性明显降低。本研究对OsRPK1基因在水稻中实现过表达和RNA干涉, 进而对OsRPK1的抗逆性功能加以探究。结果表明, OsRPK1基因表达量增加时, 水稻幼苗表现为耐盐性下降; RNA干涉则使水稻幼苗表现为耐盐性增加。盐胁迫后O...
谷子种子高质量总RNA提取方法的优化
谷子种子 总RNA提取 改良RNAiso Plus法 RNAiso Plus法 CTAB法
2020/2/27
为得到高质量的谷子种子RNA,本研究以5个不同谷子品种为材料,对RNAiso Plus法、改良RNAiso Plus法、CTAB法提取的RNA进行质量和纯度的比较。结果表明,改良RNAiso Plus法提取的总RNA完整性、纯度、浓度均优于其他2种方法提取的总RNA,5个不同谷子品种和不同萌发时期的谷子均可用改良RNAiso Plus法提取出高质量、完整性好的RNA,所得RNA产物可用于构建cDN...
为了寻找大豆抗病新基因，培育大豆新型抗性品种，利用同源克隆的方法从大豆品种科丰1号中分离出1个新的GmRDR1基因，并对其进行序列分析，组织表达、抗逆境胁迫表达分析及该基因的亚细胞定位研究。结果表明：GmRDR1基因位于大豆基因组的第2号染色体，基因全长为3 956 bp，其中ORF为3 378 bp，编码1 125个氨基酸，相对分子量和等电点分别为279.72×10.3和4.63；GmRDR1含...
为满足棉花组织micro RNA结构与功能研究的需要，建立了棉花高质量的总RNA 提取方法。以陆地棉纤维和胚珠为供试材料，采用改良的异硫氰酸胍-硫氰酸铵-酸酚法提取总RNA，利用stem-loop RT-qPCR法鉴定成熟的miRNA。结果表明此方法能得到高质量的总RNA，并且miRNA 的回收率较高，足以满足microRNA 水平的实时定量分析。
适用于转录组测序的棉花幼根总RNA提取方法筛选
棉花 转录组 RNA提取方法 根部
2014/4/1
棉花幼根中含有大量酚类物质、多糖和单宁等多种次生代谢物，且根部取样时会带有少量的泥土和有机质等污染物，因此棉花幼根RNA提取难度较大。本文采用两种试剂盒法和改良的异硫氰酸胍法，筛选适合转录组测序的提取棉花幼根RNA的方法。与试剂盒法相比，改良的异硫氰酸胍法具有浓度高、质量好等特点，能够满足转录组测序的要求。
棉花纤维发育早期RNA-Seq转录组分析
棉纤维发育早期 RNA-Seq qRT-PCR
2014/4/1
为了揭示棉花纤维发育早期基因表达变化情况，本研究以纤维长度存在显著差异的两个陆海回交近交系NMGA-062（32.58 mm）和NMGA-105（27.06 mm）为材料，利用Illumina HiSeqTM 2000对0、3 DPA（Days post anthesis）的胚珠及10 DPA的纤维进行RNA-Seq测序。六个文库进行拼接，共得到长度大于200 bp的Unigene 98464个，...
类黄酮化合物是烟草香气形成的重要前体物质,其形成需要多个调控基因的参与,查尔酮合成酶基因(CHS)是类黄酮物质合成途径中的关键基因,它的突变或沉默可能影响香气物质的形成。为了探讨CHS基因的下调表达对烟草香气的影响以及为选育优良的高香气品种提供技术,采用GATEWAY技术经BP反应和LR反应将CHS基因片段重组到表达载体pH7GWIWG2(I)上,成功构建了具有反向重复序列的CHS基因的RNAi表...
高山离子芥愈伤组织总RNA的提取方法研究
高山离子芥 改良的Trizol法 CTAB法 高山冰缘植物
2013/8/7
为了探寻提取高山离子芥（Chorispora bungeana）总RNA的最佳方法和条件。本研究分别采用改良的Trizol法、柱式离心法和CTAB法提取高山离子芥RNA，比较其得率、纯度、完整性和反转录后的PCR扩增效果；并对RNA的保存以及去RNA酶的处理进行了优化。结果表明，改良的Trizol法提取的RNA纯度和得率高、完整性好，转录后的PCR扩增效果好；RNA提取后室温保存8 h内降解较少，...
获得足够数量和高质量的RNA和DNA是进行分子生物学研究工作的基础。以小麦根腐离蠕孢菌为原料，分别采用溶菌酶法和液氮研磨法破碎真菌细胞壁提取DNA，用琼脂糖凝胶电泳、紫外吸收及聚合酶链式反应（PCR）技术进行核酸完整性和纯度检测。结果表明：两种方法在提取DNA时都同时得到了高质量的RNA；PCR检测结果表明DNA完整性比较高，两种方法得到的DNA质量相当；溶菌酶法中得到的RNA质量优于液氮法。利用...
葡萄病毒AMP基因RNA干扰载体的构建
葡萄病毒 AMP基因 RNA干扰载体 构建
2011/8/25
RNA干扰（RNAi）介导的植物抗病毒研究是近年来引起广泛关注的一项植物抗病毒基因工程策略。本文以GVA运动蛋白（MP）基因为模板扩增出了418 bp的基因片段，根据RNA干扰的基本原理，将目的片段正反向分别插入到载体pFGC5941内含子的两侧以便其转录过程中高效产生RNA发夹结构。经PCR扩增证明已成功构建以GVA MP基因为靶标的干扰载体pFGC5941-GVAFR，并成功转入农杆菌EHA1...