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【Journal of Integrative Agriculture】安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室韦朝领课题组基于SSR分子标记的安徽省茶树遗传多样性分析及核心种质构建（图）
SSR分子标记 安徽省 茶树 遗传多样性 核心种质构建
2023/12/5
茶树为多年生常绿木本植物，自然条件下以自交不亲和为主，因此具有丰富的遗传多样性。安徽省产茶历史悠久，茶区主要分布在长江南北的皖南黄山地区和皖西大别山地区，是国内少有的兼具南北气候带特点的产茶地区，孕育了丰富的茶树种质资源，同时茶树种质资源收集、保存和利用需要构建核心种质。然而安徽省茶树种质资源遗传多样性研究甚少，核心种质尚未构建。
近日，从国家知识产权局获悉武汉植物园的发明专利“一种用于苹果果实糖含量表型筛选的SSR分子标记及其应用”（ZL 201910499464.4）获国家发明专利授权。发明人：韩月彭，彭倩，马百全。将分子遗传手段应用于农作物育种具有广阔的发展前景，然而由于缺乏高精度的基因组参考信息，重要农艺性状的基因定位难以应用于生产实践。随着现代基因组学的飞跃发展，涌现了一批高质量基因组序列和注释信息，搭建了基于全基...
选取海南大学油梨种质资源圃的‘Fuerte’油梨花朵和小果进行转录组测序，获得18 010条序列，总长度为29 422 056 bp。利用MISA软件检索转录组测序数据，获得分布于4 687个序列中的6 312个SSR位点。经统计发现，SSR在所检测的序列中出现的频率为35.05%。分析SSR位点特征显示，所有类型的SSR平均长度为18.90 bp，SSR之间的平均距离为4.66 kb。‘Fuer...
对香椿进行染色体核型分析和SSR分子标记的开发。染色体核型分析发现两个居群的香椿染色体数都是56条，为2A型，香椿的染色体较为原始，变异较小。转录组测序结果共获得66 921条Unigene，从中检索得到13 324个SSR位点，分布于11 184条Unigene中，SSR出现频率为19.91%，平均分布距离为3.84 kb。优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸，分别占SSR总数的62.33...
以蛹虫草全基因组为模板查找Simple Sequence Repeats（SSR）位点并设计筛选引物进行聚
类分析。从100 对SSR 引物中选出30 对多态性高、重复性好的SSR 引物，共获得215 条多态性条带。
根据遗传相似系数（GS）采用不加权成对群算术平均法（UPGMA）进行遗传相似性聚类：材料间GS 值
的变化范围为0.527 ~ 0.995，以GS 值为0.761 水平可将46...